limma

0熱度

1回答

LIMMA包用於基因表達

我有以下列格式的RMA歸一化的矩陣： ID_REF GSM362180 GSM362181 GSM362188 GSM362189 GSM362192 244901 5.094871713 4.626623079 4.554272515 4.748604391 4.759221647 244902 5.194528083 4.985930299 4.817426064 5.151654407

r bioinformatics bioconductor limma 2012-10-17

---

2熱度

1回答

我需要一個很好的利馬教程，使用R

我想開始使用一些統計分析與limma包運行R.任何人都知道一個很好的教程？

r bioconductor limma 2011-03-16

---

0熱度

1回答

在R中使用LIMMA時使用的數據格式

有人可以給我一個當我將它導入到R中時導入到LIMMA中的微陣列數據應該是什麼樣子的小例子嗎？ 我想破譯來自微陣列樣本的差異調節基因。謝謝。

r bioconductor limma 2013-04-02

---

2熱度

1回答

R包Limma -contrast矩陣差異表達式

我正在使用limma來分析差異基因表達式。 對於建模你需要一個設計和對比矩陣。我只想知道任何人是否有經驗。 假設表達式來自野生型（WT）和突變體（M），並且這些表達式被刺激（S）或未被刺激（U）。對於野生型我有40個表達式值和突變20 所以，當我想知道哪些基因突變體與野生型相比，我應該使用哪種公式對比度矩陣有不同的反應： Diff=(M.S-M.U)-(WT.S-M.U) or Diff=(M.S

r models linear bioconductor limma 2011-04-08

---