說,我們建立了一個DF:熊貓 - ASOF()由去年的數據框
import pandas as pd
import random as randy
import numpy as np
df_size = int(1e6)
df = pd.DataFrame({'first': randy.sample(np.repeat([np.NaN,'Cat','Dog','Bear','Fish'],df_size),df_size),
'second': randy.sample(np.repeat([np.NaN,np.NaN,'Cat','Dog'],df_size),df_size),
'value': range(df_size)},
index=randy.sample(pd.date_range('2013-02-01 09:00:00.000000',periods=1e6,freq='U'),df_size)).sort_index()
它看起來是這樣的:
first second value
2013-02-01 09:00:00 Fish Cat 95409
2013-02-01 09:00:00.000001 Dog Dog 323089
2013-02-01 09:00:00.000002 Fish Cat 785925
2013-02-01 09:00:00.000003 Dog Cat 866171
2013-02-01 09:00:00.000004 nan nan 665702
2013-02-01 09:00:00.000005 Cat nan 104257
2013-02-01 09:00:00.000006 nan nan 152926
2013-02-01 09:00:00.000007 Bear Cat 707747
我想是在每個值'第二'欄,我想要第一個'最後'的價值。
first second value new_value
2013-02-01 09:00:00 Fish Cat 95409 NaN
2013-02-01 09:00:00.000001 Dog Dog 323089 323089
2013-02-01 09:00:00.000002 Fish Cat 785925 NaN
2013-02-01 09:00:00.000003 Dog Cat 866171 NaN
2013-02-01 09:00:00.000004 nan nan 665702 NaN
2013-02-01 09:00:00.000005 Cat nan 104257 NaN
2013-02-01 09:00:00.000006 nan nan 152926 NaN
2013-02-01 09:00:00.000007 Bear Cat 707747 104257
也許,這不是絕對的最好的例子,但在底部,當「第二個」是「貓」,我想最近的值當「第一」是「貓」
真實數據集有1000多個類別,因此循環遍歷符號並執行asof()看起來過於昂貴。我從來沒有任何運氣字符串傳遞在用Cython,但我想映射符號整數,並做了蠻力循環會工作 - 我希望的東西更Python。 (這仍然是相當快的)
的引用,有些脆弱用Cython黑客是:
%%cython
import numpy as np
import sys
cimport cython
cimport numpy as np
ctypedef np.double_t DTYPE_t
def last_of(np.ndarray[DTYPE_t, ndim=1] some_values,np.ndarray[long, ndim=1] first_sym,np.ndarray[long, ndim=1] second_sym):
cdef long val_len = some_values.shape[0], sym1_len = first_sym.shape[0], sym2_len = second_sym.shape[0], i = 0
assert(sym1_len==sym2_len)
assert(val_len==sym1_len)
cdef int enum_space_size = max(first_sym)+1
cdef np.ndarray[DTYPE_t, ndim=1] last_values = np.zeros(enum_space_size, dtype=np.double) * np.NaN
cdef np.ndarray[DTYPE_t, ndim=1] res = np.zeros(val_len, dtype=np.double) * np.NaN
for i in range(0,val_len):
if first_sym[i]>=0:
last_values[first_sym[i]] = some_values[i]
if second_sym[i]<0 or second_sym[i]>=enum_space_size:
res[i] = np.NaN
else:
res[i] = last_values[second_sym[i]]
return res
然後一些字典更換廢話:
syms= unique(df['first'].values)
enum_dict = dict(zip(syms,range(0,len(syms))))
enum_dict['nan'] = -1
df['enum_first'] = df['first'].replace(enum_dict)
df['enum_second'] = df['second'].replace(enum_dict)
df['last_value'] = last_of(df.value.values*1.0,df.enum_first.values.astype(int64),df.enum_second.values.astype(int64))
這樣做的問題是,如果「第二'列有任何值不在第一,你有問題。 (我不知道一個快速的方法來解決這個問題...說,如果你添加'驢'的第二個)
每1000萬行cythonic愚蠢的版本是21秒整個混亂,但只〜2爲cython部分。 (這可能是做了一個體面的數額更快)
@HYRY - 我認爲這是一個非常堅實的解決方案;在我的筆記本電腦上有一千萬行的DF,這對我來說需要大約30秒。
既然我不知道一個簡單的方法來處理,當第二列表具有條目沒有在第一,除了一個相當昂貴ISIN,我覺得HYRY的Python版本是相當不錯的。
這是相當不錯的 - 這真是一個很大比我預想的要快。謝謝! – radikalus 2013-02-24 16:57:32