如何將Pajek .paj文件導入到R的igraph中？

Question

This tutorial和package documentation描述瞭如何爲.net格式的pajek文件執行此操作，但我需要導入.paj文件。我不希望有代碼能夠導入所有的.paj文件，但也許有人的代碼可以用於一些更簡單的代碼，然後我可以修改它們用於我的目的？

Answer 1

我會用下面的方法啓動：

1. 閱讀使用readLines()整個文件。
2. 刪除註釋行，以'%'開頭的行。
3. 將線條切成小塊，以星號（'*'）開始的線條標記新片段的開始。
4. 檢查每件作品出現的順序並將其轉換爲適當的R數據結構。

在第4步，你可能有件幾種類型：

• *Network是網絡的開始。
• *Vertices定義了頂點並屬於之前的網絡。
• *Edges定義了無向邊，它屬於前一個網絡。
• *Arcs定義有向邊，它屬於以前的網絡。
• *Partition是分區的開始。
• *Vector是一個向量的開始。

對於*Network片轉換成的igraph曲線圖中，與*Vertices，*Edges和/或*Arcs，經過右它來片粘合在一起，然後通過一個textConnection()調用read.graph(..., format="pajek")。這樣你就不需要創建臨時文件。

該*Partition和*Vector件很簡單，只是將它們轉換爲R向量，使用scan()和textConnection()。

我還沒有嘗試過所有這些，但我認爲這不是太困難，應該可以正常工作。告訴我，如果你有任何困難。

此外，Pajek文件格式記錄不完整，所以我可能是錯的，可能還有其他類型的片等

您也可以考慮在igraph bug tracker加入一個bug報告，請求該功能。