什麼是醫學成像應用的計算瓶頸算法?我們試圖找出在常規雲服務器實例或GPU加速服務器實例上運行這些算法是否有好處。醫學成像應用的瓶頸算法是什麼?
回答
除非軟件是專門針對GPU處理能力設計的,否則GPU加速實例與普通商品服務器實例的性能大致相同,只是價格較高。
我願意賭博,並說任何算法,醫療與否,成像與否的瓶頸是你可以在CPU上扔數據的速度,核心數量和時鐘頻率。
獲得一些快速的CPU,瘋狂的快速RAM,盲目快速的條紋/鏡像存儲,並這樣做。
我懷疑你可能會發現在「雲」上運行實際上是違反直覺的,或者至少會適得其反,因爲許多雲服務提供商不會調整其存儲後端以滿足高性能計算的需求,但更多的是爲大衆提供一點IO。
我認爲你擁有專用硬件會更好,這樣,你可以花更多的時間和金錢來有效地調整硬件堆棧以匹配你的軟件堆棧。任何雲服務提供商(包括亞馬遜)都會給你一些權衡和妥協。
哦,別忘了不要把所有的eggs in one basket.亞馬遜下線時會發生什麼,沒有人可以檢查任何X-Rays,或者是在Amazon Cloud實例上放置heart monitoring application的可憐schmuck,而且亞馬遜離線在一個巨大的停電。
除了雲託管的妥協,冗餘和恢復供應商中斷的問題,不把重要的基礎設施放在雲上,還有其他問題圍繞着你的應用程序本身的架構。它是否會線性擴展?
我敢打賭,它不會。
不是一個有用的答案:這個問題是一個算法問題,而不是一個評論雲民間傳說的請求。有很多提供GPU加速的面向HPC的雲,Nimbix,SGI Cyclone和Sabalcore。所以回到這個問題,醫學成像的瓶頸運營商是什麼?它是一個約束求解器,一個特徵值求解器,一個PDE求解器,光譜操作? – Ravenwater 2012-01-01 20:01:06
你應該知道你的算法,或寫出更好的問題。 Drainwater。 – 2012-01-02 15:33:02
謝謝你的時間。我很抱歉讓你不高興。 – Ravenwater 2012-01-03 22:01:55
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通過利用Matlab Parallel Toolbox,Acceleware AxRecon或Accelereyes Jacket等產品,應用程序開發人員可獲得GPU加速。問題的關鍵是瓶頸運營商是什麼,以便我們可以預測如果我們改變運營商的利益和影響。 – Ravenwater 2012-01-03 22:07:32