用於圖像分析的感興趣區域繪圖工具（在python中）

爲了擺脫IDL和Matlab，我正在探索需要在python/scipy等中實現哪些工具。一個共同的特徵是顯示醫學圖像和輪廓感興趣的區域（例如IDL中的defroi，或者是GIU版本，xroi）。在chaco和matplotlib中，有一些LassoSelection工具的例子很接近，但並不適合我的需求（我想單擊並單擊一個多邊形而不是拖動光標）。用於圖像分析的感興趣區域繪圖工具（在python中）

是否有現成的工具可以做到這一點，或者我是否需要擴展和定製現有的類？在任何一種情況下，正確方向的指針都會有所幫助。

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2011-02-18 DrSAR

我想你可能可以使用PyQTGraph來達到這個目的，https://launchpad.net/pyqtgraph。我只是謹慎地使用它，因爲它比matplotlib有更少的先天選擇，但它非常快，它有一些內置小部件，用於感興趣的ROI選擇。您可能會發現自己構建自定義然而，繪製將matplotlib與PyQTGraph合併的例程，如果格式不同，會導致頭疼，等等。它可以導致更多的簿記，但可以解決您的問題。

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2011-02-22 22:36:53 ely

感謝您的提示：我曾看過，但在某些情況下，示例test_ *似乎有點脆弱。有點依賴於此。我想我可能只需要用matplotlib + pyQt去自己製作的路線。 – DrSAR 2011-03-03 07:15:33

看起來，matplotlib並不適合拍攝包含感興趣區域繪圖等功能的交互式數據vsiualization。雖然它確實處理事件處理等。

目前爲止我能想出的最好的是guiqwt這個名字的令人印象深刻的努力。它基於PyQwt，另外還有一些相當容易滿足的依賴項。快速瀏覽test examples of image visualization顯示了一個便利的工具集。安裝和運行這些示例很容易。時間會告訴我們融入自己的工作是多麼容易。

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2011-04-05 23:32:22 DrSAR

現在matplotlib有一個很好的小部件叫做「LassoSelector」，它使得自由多邊形繪圖變得非常簡單。

示例代碼瀏覽： http://matplotlib.org/examples/widgets/lasso_selector_demo.html

我的簡約版本：

from pylab import * 
from matplotlib.widgets import LassoSelector 

fig, ax = plt.subplots() 
ax.imshow(np.random.randint(0,255,(255,255)), cmap='gray') 

def onselect(verts): 
    print verts 

lasso = LassoSelector(ax, onselect) 

subplots_adjust(left=0.1, bottom=0.1)

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2014-04-22 15:48:38 otterb

有一個很好的工具，不正是你想要jdoepfert可在github什麼。我的機器性能有點慢，但如果你註釋掉motion_notify_event它就像一個魅力。

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2017-04-05 16:41:15 lhcgeneva

用於圖像分析的感興趣區域繪圖工具（在python中）

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