如何使用MPI創建主機文件？

我需要在8個節點上運行MPI應用程序，每個節點有16個CPU。即使經過一番研究，我仍然不明白宿主文件是如何工作的。我使用R與doMPI和Rmpi庫。如何使用MPI創建主機文件？

這是我的理解至今：

我有一個HOSTFILE my-hosts看起來像：

node1 slots=16 
node2 slots=16 
. 
. 
.

我可以簡單地通過nodeX調用節點？

如何獲取節點的名稱？

是否有任何功能，如getNodeName()？

以下命令行是否足以啓動應用程序？

mpirun -np 1 -host my_host ....

是否有必要在所有節點上都有hostfile？

來源

2016-11-14 olegario

爲了避免我們重複您已經閱讀的內容，請在閱讀後說明您不理解的內容。它也可能有助於在計算機上提供詳細信息，例如操作系統。相關：https://www.open-mpi.org/faq/?category=running#mpirun-hostfile –

@ Hack-R，我只是更新我的問題。往上看。 ;） – olegario

節點的名稱必須是它們的IP地址或它們的DNS主機名。如果知道IP地址，可以通過查詢DNS服務器（取決於您的系統：Windows，Linux等）來獲取節點的名稱。

例子：

localhost 
192.168.1.2 
host01.clusterdomain

我建議你檢查，如果你正在使用的系統使用任何類型的job scheduler。如果是這樣，則不需要關心指定主機文件，因爲作業調度程序會處理該問題（您只需指定資源節點的數量即可）。

最後，如果您正在執行的進程管理器（的mpirun，mpiexec的等）HOSTFILE僅在主機必要的。但是，使用共享文件系統將確保您的應用程序所需的所有文件（包括主機文件（如果您需要的話））將在羣集的每個節點上可用。

來源

2016-11-16 21:51:33

謝謝兄弟！最後一個問題，即使有一個工作調度程序，我仍然需要使用-H name_node1，name_node2 ...？ – olegario

如果你有一個工作調度器，你可能根本不需要擔心主機名**（因爲主機可能會根據集羣的繁忙程度而改變）。通常您只需調用'mpirun/your/app/binary arguments'，MPI實現就會使用作業調度程序設置的環境變量來猜測您的作業配置。如果你想做更精細的事情，這可能不適用，但對於最典型的用途，它可以直接使用。查看你的工作調度程序文檔，或要求管理員安裝一個（有許多可用，包括開源軟件）。 –

如何使用MPI創建主機文件？

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