如何延長igraph網絡圖（layout = fruchterman.reingold）中的邊緣？

Question

試圖在R做網絡圖。 如何使用IGraph來加長網絡圖中的邊？

我實際上想使用fruchterman-reingold佈局。有什麼方法可以使這種基於力的算法「更具彈性」，使我的頂點更加分離？

謝謝。

Answer 1

您可以使用layout.fruchterman.reingold函數來控制Fruchterman-Reingold算法。見：help('layout.fruchterman.reingold')。我經常使用的一個設置，並且讓您獲得更多的間距：

l <- layout.fruchterman.reingold(g,niter=500,area=vcount(g)^2.3,repulserad=vcount(g)^2.8) 
plot(g,layout=l) 

其中g是您的圖形對象。最好只爲圖表測試這些參數的不同值，看看有什麼作用。特別是repulserad會影響圖形中的間距。默認值是節點數量的平方，所以更高的值應該讓你獲得更多的空間圖。

Answer 2

如果layout.fruchterman.reingold算法仍然沒有通過調整參數給出您想要的值，只需執行以下操作即可。每個佈局都會返回一組座標，其中x和y座標分別位於第一列和第二列中。你可以在這裏應用任何你喜歡的轉換，如果你只是想縮放它，只需使用

L = layout.fruchterman.reingold(G)*s; #Scaling factor s 

當然也可以使用更多花哨的轉換。爲了記錄，您還可以使用tkplot(G, layout=L)用鼠標手動編輯佈局。您可以通過L = tkplot.getcoords(1)獲取座標。