套索錯誤glmnet NA/NaN的/ INF

Question

我有一個問題與glmnet中，我不斷收到錯誤消息

"Error in elnet(x, is.sparse, ix, jx, y, weights, offset, type.gaussian, : NA/NaN/Inf in foreign function call (arg 5) 
In addition: Warning message: 
In elnet(x, is.sparse, ix, jx, y, weights, offset, type.gaussian, : NAs introduced by coercion" 

下面我就可以複製與「IRIS的數據設置錯誤，但這裏是我的特殊數據簡化代碼：

vars <- as.matrix(ind.vars) 
lasso <- glmnet(vars, y=cup98$TARGET_D, alpha=1) 

這裏的東西，你可以很容易地重現：

data(iris) 
attach(iris) 
x <- as.matrix(data.frame(Sepal.Width, Petal.Length, Petal.Width, Species)) 
y <- Sepal.Length 
lasso <- glmnet(x,y=y, alpha=1) 

謝謝很多人！

Answer 1

隨着as.matrix你是因爲你留在「種」強迫字符的數值：

str(as.matrix(iris[, c('Sepal.Width', 'Petal.Length', 'Petal.Width', 'Species')])) 
chr [1:150, 1:4] "3.5" "3.0" "3.2" "3.1" "3.6" "3.9" ... 
- attr(*, "dimnames")=List of 2 
    ..$ : NULL 
    ..$ : chr [1:4] "Sepal.Width" "Petal.Length" "Petal.Width" "Species" 

而且通常是非常壞主意使用attach/detach，如果你不知道你爲什麼不應該使用它，那麼你大多數絕對應該不是使用它。

data(iris); require(glmnet) 
x<-as.matrix(iris[, c('Sepal.Width', 'Petal.Length', 'Petal.Width')]) 
y<-iris$Sepal.Length 
lasso<-glmnet(x,y=y, alpha=1); lasso # no error