錯誤'Out of memory'是什麼原因？

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dim(B) 
> 3025 3025

當我嘗試使用這個矩陣，以創建我收到錯誤的圖形對象：

library(igraph) 
g <- graph.adjacency(B, weighted=TRUE, mode="undirected", diag=FALSE) 

# Error in .Call("R_igraph_weighted_adjacency", adjmatrix, 
# as.numeric(mode), : 
# At vector.pmt:439 : cannot reserve space for vector, Out of memory

什麼是錯誤的原因是什麼？這是R還是我的電腦的限制？

> sessionInfo() 
R version 3.2.3 (2015-12-10) 
Platform: i386-w64-mingw32/i386 (32-bit) 
Running under: Windows Vista (build 6001) Service Pack 1 

attached base packages: 
[1] stats  graphics grDevices utils  datasets methods base  

other attached packages: 
[1] igraph_1.0.1

更新（@Gabor意見後）。我試圖重現錯誤。我用過：

B <- matrix(runif(3025*3025, 0, 10), nc = 3025) 
#Error: cannot allocate vector of size 69.8 Mb 
g <- graph.adjacency(B, weighted=TRUE, mode="undirected", diag=FALSE) 
object.size(B) 
#73423056 bytes 
object.size(g) 
#395900 bytes

但是錯誤是不一樣的。該錯誤是在庫（igraph）調用函數之前發生的。然後我寫了

B<-c() 
>B 
NULL 
B <- matrix(runif(3025*3025, 0, 10), nc = 3025) 
g <- graph.adjacency(B, weighted=TRUE, mode="undirected", diag=FALSE) 
Error in .Call("R_igraph_weighted_adjacency", adjmatrix, as.numeric(mode), : 
    At vector.pmt:439 : cannot reserve space for vector, Out of memory 
dim(B) 
#[1] 3025 3025 
object.size(B) 
#73205112 bytes 
object.size(g) 
#395900 bytes

來源

2016-02-05 Nick

Windows Vista的問題？ 32位問題？ B < - 矩陣（樣本（0：1，9150625，替換= TRUE，概率= c（0.9,0.1）），nc = 3025）。 graph.adjacency（B，weighted = TRUE，mode =「undirected」，diag = FALSE）在64位Linux上運行。 'B'裏面有什麼？ – 2016-02-05 04:05:35

在我的機器上，我正在看它。它使用43GB的RAM來計算。然後60GB。我認爲這是針對較小的數據集。 –

@BrandonBertelsen您可以分享您的代碼片段嗎？我發表評論時看不到這樣的高峯。 – 2016-02-05 04:09:19

誤差不會從來了，它總是從graph.adjacency來了。
igraph針對稀疏圖進行了優化，您的圖是完整的圖，所以這並不理想。
最重要的是，你需要更多的記憶。該圖需要大約300 MB的內存，顯然你沒有。

我不知道你怎麼能叫object.size上g，如果你無法創建它。

來源

2016-02-06 21:53:53

感謝詳盡的答覆。我想結果'對象。大小（g）'是爲另一個（更小的）igraph對象獲得的，我應該清除一個象'B <-c（）'的igraph對象。 – Nick

錯誤'Out of memory'是什麼原因？

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