在其他統計軟件包中的降價比R

我是R markdown的忠實粉絲，發現它比編織LaTeX快速項目文檔（少於15頁）更容易。但是，我還需要支持其他統計軟件包（SPSS,Stata + SAS），並且想知道這些軟件的等效解決方案。在其他統計軟件包中的降價比R

在某種程度上，這可能會回到使用某種原始Noweb代碼+標記文件來編譯通過命令行。我想從R調用其他軟件包是另一種選擇。

我看過John Muschelli的這個例子：http://rpubs.com/muschellij2/3888，看起來好像他將Stata代碼編入R markdown文件。

您對這個主題有什麼想法？

我確實知道SASweave和StatWeave（後者明顯是壞的???），但認爲降價解決方案在我們的情況下更具優勢。

來源

2013-12-12 Joanne Demmler

約翰Muschelli向我指出這塔塔計劃：

https://github.com/amarder/stata-tutorial/blob/master/knitr.do

它解析一個.domd文件，其中包含降價和Stata的代碼，並生成一個.md文件，執行Stata的代碼。要解析的文件的名稱位於knitr.do文件的末尾。

更多比較特別：

從https://github.com/amarder/stata-tutorial/blob/master/knitr.do
下載knitr.do文件從https://github.com/amarder/stata-tutorial/blob/master/clustered-standard-errors.domd
保存他們兩個下載clustered-standard-errors.domd文件中的某些目錄。
修改的knitr.do的最後一行，以反映其目錄的完整路徑（例如 d：\桌面\ knit_example \集羣標準，errors.domd
運行knitr.do讓你降價（ .md）文件（和中間.md1文件）。

注意knitr.do包含所做的工作和線方案（最後一個）：

knit "whatever-file.domd"

調用該程序。

所以你基本上寫一個.domd文件[步驟（2）的文件只是一個例子]，包含Markdown語法和Stata命令，運行knitr.do調整文件名，並獲得帶有執行Stata命令的Markdown文件。

有幾個注意事項：

只有一個班輪的Stata命令是允許的。例如，循環將不起作用。
「.domd」不能是文件名的一部分。
如果Stata命令出現錯誤，用戶將得不到任何返回碼。
如果用戶在程序運行時遇到Break按鈕或者存在Stata命令錯誤，則需要手動關閉文件句柄。

來源

2013-12-13 18:05:11

我不太確定如果我明白我需要運行腳本以及如何修改它的順序，但它看起來是正確的！謝謝 –

我已經添加了一些細節到我的答案。我希望他們幫助。 –

我不確定這是否是您想要的，但是如果您希望在SAS中創建包含統計報告的.html文件，那麼您可以使用輸出傳遞系統（ODS）。

實施例的語法是：

ods html file='pathofdirectory\filename.html' <additional options>; 
    proc print... (SAS code that generates output) 
    proc means... 
    proc freq... 
    proc gchart... 
    proc gplot... 
    ...   
ods html close;

來源

2013-12-12 10:20:44

我實際上想要比ods設置更進一步，並在報告中包含大量其他輸入，即大量文本，圖像，引用（pandoc + latex）和從統計中獲取的單個數字表。結果應該是這樣http://support.sas.com/resources/papers/proceedings12/324-2012.pdf - 這是一個完全可重複和自包含的分析文件。優選地，所有不同統計數據包的方法應儘可能相似。 –

Stata的具有其自己的SMCL原木的註釋，所述M靜置加價。使用不同語言的主要原因是，在文檔沒有結束的情況下，即在交互式會話中，SMCL必須逐行創建和解釋。這是由Stata在您提出要求時自動創建的，可由用戶或程序員作爲調整Stata顯示選擇的一種方式進行規定。

與您的問題可能的聯繫是SMCL可以被翻譯成HTML，它可以打開各種門。所以，在Stata中很容易的事情就是做一些工作，在SMCL中保存log文件，然後將日誌文件轉換爲HTML。如果沒有進一步的工作，你不會得到任何好東西，但是進一步的工作很簡單，並且相當於按照你的方式做任何事情，但在你最喜歡的文本編輯器或文本處理器中，而不是在Stata中。

這可以通過log2html來簡化，Stata用戶可以使用ssc inst log2html進行安裝。它利用了Stata中沒有記錄的功能。

Stata的幫助文件也可以用相同的方式翻譯成HTML（但考慮到版權問題，如果在官方幫助文件中這樣做;這對您自己的幫助文件是公平的）。

來源

2013-12-12 10:58:51

這是一個有趣的方法謝謝。另一種可重現文檔的解決方案是使用Word中的Stata和SAR宏http://www.stata.com/meeting/italy11/abstracts/italy11_lo_magno.pdf –

我想是的。沒有味道的會計...... –

@JoanneDemmler喬安妮，請張貼您的評論作爲答案。幾乎錯過了它。看起來Haghish的解決方案（正在積極開發）將成爲Stat'可以獲得的'knitr'最接近的解決方案。 – radek

由於需要將所有內容寫入磁盤，SPSS（以及SAS I所假設）有一定的開銷，這使得編譯一舉減少了吸引力。與Yick提到的類似，SPSS具有一個輸出系統，可以編寫自動報告並開始輸出爲HTML或PDF或Word。讓它看起來不錯是最容易的事情，但它可能並且可以添加以減輕自動編輯（主要通過Python腳本）正在定期推出。

基本上我現在用SPSS和R編寫的自動化報告有html shell。代碼然後只是更新或插入所需的表和圖形。它們完全獨立，可重複，並且可在每週或每月的定時器上運行，無需人工干預。他們只是沒有內聯代碼塊來精確定義表格的生成方式（你必須稍微追溯代碼才能找出結果 - 但這並不是太麻煩）。

由於SPSS允許您從Python命令提示符運行SPSS代碼，因此理論上可以使用調用SPSS的Python代碼編寫文檔。我不太確定我是否看到了這個優勢，但是在分開的位置有更多的分段代碼。你真的想讀取以SQL查詢開頭的100行SPSS代碼，做一些轉換並生成一張表格和一張圖表嗎？難道你不願意看到表格和圖表，然後如果對本質感興趣可以回頭看看準備好所有數據的DataPrep.sps，然後看Table1.sps和Figure1.sps等等，看看它們是如何準確產生的？

來源

2013-12-12 13:32:34

我認爲答案是，對於完全可重現的示例，您希望將代碼包含到文檔中，或者至少在完全相同的實例中生成輸出。但我確實喜歡Python-SPSS接口的想法！ –

SPSS的默認行爲是在查看器中的Notes對象中自動包含語法。 SPSS還支持日誌文件，可以捕獲會話中幾乎所有的事情。（SPSS還包含Java，R和.NET接口） – JKP

在其他統計軟件包中的降價比R

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