我有movielens dataset,我想將PCA應用於它,但sklearn PCA函數似乎不能正確執行它。
我有718 * 8913矩陣的行表示用戶和列表示電影 這裏是我的Python代碼:在movielens數據集上應用sklearn PCA
加載影片的名字和電影分級
movies = pd.read_csv('movies.csv')
ratings = pd.read_csv('ratings.csv')
ratings.drop(['timestamp'], axis=1, inplace=True)
def replace_name(x):
return movies[movies['movieId']==x].title.values[0]
ratings.movieId = ratings.movieId.map(replace_name)
M = ratings.pivot_table(index=['userId'], columns=['movieId'], values='rating')
df1 = M.replace(np.nan, 0, regex=True)
規範
X_std = StandardScaler().fit_transform(df1)
應用PCA
pca = PCA()
result = pca.fit_transform(X_std)
print result.shape
plt.plot(np.cumsum(pca.explained_variance_ratio_))
plt.xlabel('number of components')
plt.ylabel('cumulative explained variance')
plt.show()
我沒有設置任何組件編號,因此我預計PCA會在新維度中返回718 * 8913矩陣,但pca結果大小爲718 * 718,pca.explained_variance_ratio_
大小爲718,並且它的所有成員的總和爲1,但這是怎麼回事可能!!!
我有8913的功能,它只返回718和它們的方差之和等於1任何一個可以解釋這裏有什麼問題嗎?
我的情節圖片結果: 正如你可以在上面的圖片中看到它只包含718組件和它的總和爲1但我有8913功能,他們走了嗎?
較小的例如測試
我即使scikit嘗試學習可以在PCA Here is the Link的文檔頁面中找到我修改這個例子,只是增加的功能
import numpy as np
from sklearn.decomposition import PCA
import pandas as pd
X = np.array([[-1, -1,3,4,-1, -1,3,4], [-2, -1,5,-1, -1,3,4,2], [-3, -2,1,-1, -1,3,4,1],
[1, 1,4,-1, -1,3,4,2], [2, 1,0,-1, -1,3,4,2], [3, 2,10,-1, -1,3,4,10]])
ipca = PCA(n_components = 7)
print (X.shape)
ipca.fit(X)
result = ipca.transform(X)
print (result.shape);
,並在數PCA例子這個例子中我們有6個樣本和8個發起人,我將n_components
設置爲7,但結果大小爲6 * 6。
我認爲,當特徵數大於樣本數更大scikit學組件的最大數量PCA將返回等於樣本數
我厭倦了n_components每n_components超過718 dose't工作做大終於返回718個組件 –
這裏的答案似乎表明,從根本上,尺寸的最大數量PCA可以減少爲min(N_SAMPLES次,n_features) :http://stackoverflow.com/questions/22557883/scikit-learn-pca-dimension-reduction-data-lot-of-features-and-few-samples?rq=1 –