曼特爾測試中的R

Question

我試圖在在兩個距離（地理距離和遺傳Distancse）運行曼特爾試驗R。

將數據保存在Excel文件中作爲2列;每行有2個種羣之間的地理距離和遺傳距離。

我運行以下命令返回出於某種原因

mantel.rtest(mydata$Dis, mydata$Fst, nrepet = 99) 

錯誤消息是錯誤的情況如下：

Error in mantel.rtest(mydata$Time, mydata$Fst, nrepet = 99) : 
    Object of class 'dist' expected 

希望得到任何反饋。

Answer 1

您必須將數據轉換爲dist（）數據。 disydist < -dist（mydata $ Dis）和fst.dist < -dist（mydata $ Fst），然後使用dist值運行mantel.rtest。