在R中，如何根據另一個對象的類來設置S4類

我需要從Bioconductor的ShortRead庫創建ShortReadQ類型的對象。在R中，如何根據另一個對象的類來設置S4類

ShortReadQ 'signature(sread = "DNAStringSet", quality = 
      "QualityScore", id = "BStringSet")'

質量時隙必須是一個對象從繼承的QualityScore，其中我可以很容易地從我希望模擬另一ShortReadQ對象確定。

> class(quality(anotherObject)) 
[1] "SFastqQuality" 
attr(,"package") 
[1] "ShortRead"

在構造函數參數中使用該信息（「SFastqQuality」）的最佳方式是什麼？

newObject<-ShortReadQ(sread=..., 
      quality=SFastqQuality(...), 
      id=...)

我不明白這個問題。你可能想嘗試進一步澄清你的問題，或嘗試bioconductor的幫助：http://www.bioconductor.org/docs/postingGuide.html。 – Shane 2010-03-02 01:21:26

我想獲得給定對象的類名，並在新對象的構造函數中使用它。什麼是最好的方式來做到這一點？ – 2010-03-02 02:29:40

感謝您的答覆。他們導致我的解決方案工作

newObject<-ShortReadQ(sread=..., 
      quality=new(Class=class(quality(anotherObject)),theFirstParameter=...), 
      id=...)

2010-03-02 20:10:35

這是做你想做的嗎？

quality = new(class(old.quality.obj)[[1]]))

2010-03-02 04:25:11

你可能想get函數：

a <- get(class(object)) 
a(...)

2010-03-02 04:50:00 Shane

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