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我需要將DNA序列翻譯成其相應的氨基酸序列。我編寫了整個程序,但是我在輸出生成方式方面遇到困難。Python嵌入變量輸出
總之,我有這樣的代碼:
for x in f1:
x = x.strip()
if x.count("seq"):
f2.write((x)+("_1_+\n"))
f2.write((x)+("_2_+\n"))
f2.write((x)+("_3_+\n"))
f2.write((x)+("_1_-\n"))
f2.write((x)+("_2_-\n"))
f2.write((x)+("_3_-\n"))
else:
f2.write((translate1(x))+("\n"))
f2.write((translate2(x))+("\n"))
f2.write((translate3(x))+("\n"))
f2.write((translate1neg(x))+("\n"))
f2.write((translate2neg(x))+("\n"))
f2.write((translate3neg(x))+("\n"))
,讓這樣的輸出:
>seq1_1_+
>seq1_2_+
>seq1_3_+
>seq1_1_-
>seq1_2_-
>seq1_3_-
iyyslrs-las-smrlssiv-m
fiirydrs-ladrcgshrssk
llfativas-lidaalidrl
frrsmraasis-lativannkm
lddr-ephrsas-lrs-riin
-tidesridqlasydrse--m
但我需要的是這樣的:
>seq1_1_+
iyyslrs-las-smrlssiv-m
>seq1_2_+
fiirydrs-ladrcgshrssk
>seq1_3_+
llfativas-lidaalidrl
>seq1_1_-
frrsmraasis-lativannkm
>seq1_2_-
lddr-ephrsas-lrs-riin
>seq1_3_-
-tidesridqlasydrse--m
所以,我的問題是,我該如何解決這個問題?
您正在將它們一起印刷。這很明顯,爲什麼輸出是如此... – gravetii
看起來像你把不適合的東西混合成一個數據結構。請發佈您的整個程序,以便我們能夠更好地幫助您。 – Michael