修復在Mac OS X中內置的開放式MPI包

幾天前，我試着編譯並製作CUDA Toolkit 5.0示例以驗證安裝。但是，在製作過程中，製作簡單的MPI樣本時出現錯誤。沒有進入細節我假設我需要安裝Open MPI到我的主機。我已經下載了當時的最新版本，例如的openmpi-1.6.2。然後根據Open MPI FAQ page我已經運行修復在Mac OS X中內置的開放式MPI包

./configure --prefix=/usr/local 
    make all install

但不幸的是有make命令中的錯誤。我決定深入研究，發現Mac OS X有一個內置的Open MPI軟件包。我發現一個更FAQ page for Mac OS X users，並試圖安裝Open MPI在/ opt /文件夾的openmpi這樣

./configure --prefix=/opt/openmpi 2>&1 | tee config.out 
    shell$ make -j 4 2>&1 | tee make.out`

有再次沒有運氣。使失敗。那一刻，我明白我可以跳過簡單的MPI樣品，我就這麼做了！

再次，沒有進入細節，我決定清理我的系統從不需要的文件，並做了愚蠢的事情make unistall而不是make clean。

現在，nvcc編譯器似乎壞了，我需要重新安裝或修復內置的Open MPI bundle。

問題是我該如何做到這一點？雖然我有TimeMachine備份。

P.S.簡單的CUDA CUDA示例的問題描述如下：here。如何製作簡單的MPI樣本已經有了明確的答案。

UPDATE [22:09 UTC 2012年11月3日]

都有成功MPICH2安裝後沒有運氣。正確的值添加到PATH：

vim ~/.bash_profile 
    export MPI_DIR=/usr/local/Cellar/mpich2/1.5/ 
    export PATH=$MPI_DIR/bin:/usr/local/cuda/bin:/Developer/NVIDIA/CUDA-5.0/bin:$PATH 
    export LD_LIBRARY_PATH=$MPI_DIR/lib:$LD_LIBRARY_PATH 
    export DYLD_LIBRARY_PATH=/usr/local/cuda/lib:$DYLD_LIBRARY_PATH 
    export EDITOR=vim

通過終端呼叫運行NSight nsight。這很重要，因爲我試圖將NSight鎖定在碼頭。但是從Dock NSight運行時找不到GPU設備。所以每次我使用終端。

我試圖創建新的CUDA運行時C/C++項目，並簡單地運行它。但是NSight每次都以相同的方式失敗。這裏是：

nvcc -G -g -O0 "src/Simple CUDA RT Proj.o" "../src/Simple CUDA RT Proj.cu" 
    i686-apple-darwin11-llvm-g++-4.2: src/Simple CUDA RT Proj.o: No such file or directory 
    make: *** [src/Simple CUDA RT Proj.o] Error 1

每個項目相同的問題主要.o文件丟失。

UPDATE [10時36 UTC 2012年11月4日]

我已經經由釀造安裝Fortran編譯器。並試圖建立前綴爲urs/local的OMPI（根據OSX FAQ實體）。失敗，錯誤一兩個小時化妝後：

sh: usr/local/cuda/bin/echo: No such file or directory 
    make[2]: *** [util/hostfile/orte_hosts.7] Error 127 
    make[2]: *** Waiting for unfinished jobs.... 
    make[1]: *** [all-recursive] Error 1 
    make: *** [all-recursive] Error 1

UPDATE [13:40 UTC 2012年11月5日]

試圖建立開放MPI-V1。9如下參數：

./configure --enable-shared --enable-sharedlibs=osx-gcc --enable-fast=all --prefix=/usr/local --with-cuda=/usr/local/cuda --with-cudalib=/usr/local/cuda/lib

現在做失敗，類似的錯誤：

sh: usr/local/cuda/bin/mv: No such file or directory

看起來像化妝腳本嘗試訪問CUDA/bin目錄內頂級的二進制文件，使失敗。看起來make-script錯誤地將諸如mv或echo等相對較快的系統範圍調用轉換爲使用cuda bin目錄的絕對路徑。這是不正確的配置選項還是Open MPI錯誤？

或者，也許Open MPI不是主要問題？也許我應該找別的東西？我的主要煤炭正在運行CUDA代碼！

來源

2012-11-03 Geradlus_RU

從Mac OS X Lion（10.7）開始，Apple不再提供操作系統的Open MPI二進制文件。順便說一句，在'.bash_profile'中有兩個拼寫錯誤：CUDA二進制文件路徑中缺少初始'/'，CUDA動態庫路徑中沒有'/'。 –

@HristoIliev昨天已經刪除了這個錯字！我沒有運氣（我決定重新安裝操作系統。準備一切:) –

@HristoIliev感謝您提供有關OMPI和Lion的有價值的信息！我的主要問題不是OMPI，而是文件路徑中的空格（[解決方案]）（http://stackoverflow.com/questions/13237371/cuda-toolkit-5-0-nsight-build-errors-on-mac-os -x毫升））。我無法發佈答案，所以你可以這樣做嗎？） –

原來問題是由文件路徑中的空白引起的，與this question中的情況類似。

來源

2012-11-07 12:01:51

修復在Mac OS X中內置的開放式MPI包

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