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任何有關爲什麼我會收到錯誤在TCGABiolinks中運行標準化步驟?TCGABiolinks錯誤:名稱(y)< - 1:長度(y):'名稱'屬性[2]中的錯誤長度必須與向量[0]的長度相同
任何有關爲什麼我會收到錯誤在TCGABiolinks中運行標準化步驟?TCGABiolinks錯誤:名稱(y)< - 1:長度(y):'名稱'屬性[2]中的錯誤長度必須與向量[0]的長度相同
對我來說,原因是我第一次提供了錯誤的geneInfo
數據。在我的數據集中,我有在geneInfo
數據集中未使用的Ensemble ID(只需在R中輸入「geneInfo」,您將看到帶有基因ID的表格)。
但是,TCGAbiolinks
爲HTSeq-Counts提供了geneInfoHT
數據集 - 此工作適用於我。我的最後一個命令是這樣的:
dataNorm <- TCGAanalyze_Normalization(tabDF = data1, geneInfoHT)
你的一些數據顯示爲空。 –
這不是空的,用於分析ht-counts數據的bioconductor代碼是有缺陷的。 – Kimberly