如何分割，並用awk

Question

我只有4列的製表符delim文本文件，如下所示列替換字符串：

GT:CN:CNL:CNP:CNQ:FT .:2:a:b:c:PASS .:2:c:b:a:PASS .:2:d:c:a:FAIL 

如果在一個特定的列從開始找到字符串「失敗」 column2到columnN（所有的字符串用「：」分開），那麼它需要將該列中的第二個元素替換爲「-1」。示例輸出如下所示：

GT:CN:CNL:CNP:CNQ:FT .:2:a:b:c:PASS .:2:c:b:a:PASS .:-1:d:c:a:FAIL 

任何使用awk的幫助？

Answer 1

對於任何AWK：

$ awk 'BEGIN{FS=OFS="\t"} {for (i=2;i<=NF;i++) if ($i~/:FAIL$/) sub(/:[^:]+/,":-1",$i)} 1' file 
GT:CN:CNL:CNP:CNQ:FT .:2:a:b:c:PASS .:2:c:b:a:PASS .:-1:d:c:a:FAIL 

Answer 2

隨着GAWK：

awk '{$0=gensub(/[^:]*(:[^:]*:[^:]*:[^:]:FAIL)/,"-1\\1", "g" , $0)};1' File 

與SED：

sed 's/[^:]*\(:[^:]*:[^:]*:[^:]:FAIL\)/-1\1/g' File 

Answer 3

如果您正在使用GNU awk的，你可以採取RT功能的優勢，並在製表符和換行符拆分記錄：

awk '$NF == "FAIL" { $2 = "-1"; } { printf "%s", $0 RT }' RS='[\t\n]' FS=':' infile 

產量：

GT:CN:CNL:CNP:CNQ:FT .:2:a:b:c:PASS .:2:c:b:a:PASS .:-1:d:c:a:FAIL 

_{隨後的當前記錄的記錄分隔符。}

Answer 4

爲了在awk中分割，你可以使用"split"。

它的一個例子是如下：

split(1,2,"3"); 

1. 1是要拆分
2. 2字符串被要將其分成
3. 和3中的陣列是字符，你想分裂在

例如

string="hello:world" 
result=`echo $string | awk '{ split($1,ARR,":"); printf("%s ",ARR[1]);}'` 

在這種情況下，因爲我們分割字符串到其結果將是等於hello,「：」字符和我們打印的ARR的前半部分，如果我們將打印所述第二半（這樣的printf（」 ％s「，ARR [2]）），那麼它將被返回以產生」世界「。

Answer 5

你的要求有些模糊，但我敢肯定，這確實要與沼澤標準的awk（不GNU的awk的擴展）什麼：

awk '/FAIL/{$2=-1}1' ORS=\\t RS=\\t FS=: OFS=: input