如何在foreach中指定R包的位置（...，.packages =「pkg」）％dopar％

Question

我的「pkg」安裝在別的地方，我怎麼能告訴foreach在哪裏可以找到包？

foreach(i = 1:2,.packages="pkg") %dopar% { ... } 

這給我的錯誤信息：

worker initialization failed: there is no package called 'pkg' 

謝謝您的幫助。

Answer 1

您可以使用.libPaths()函數在運行會話中設置庫路徑。

否則啓動文件如~/.Renviron可以提供幫助，請參閱?Startup。

最後，如果您使用foreach運行不同的機器，您需要照顧每臺機器上的庫路徑。

Answer 2

另一種方法是你打電話之前foreach向.libPaths分發到所有工人：

library(foreach) 
library(doParallel) 

#setup parallel backend to use 8 processors 
cl<-makeCluster(8) 
registerDoParallel(cl) 

# pass libPath to workers, NOTE THIS LINE 
clusterCall(cl, function(x) .libPaths(x), .libPaths()) 

parallelResults <- foreach(i = 1:42, .combine = rbind) %dopar% { 
    # do your stuff 
}