如何使用imageJ來合併不同的渠道和做az平均

Question

我有十個tiff文件，每個包含兩個通道的成像數據，我想標記兩個通道的不同顏色，然後做az投影，任何人都知道怎麼做？

Answer 1

首先，讓自己熟悉ImageJ的顯示pseudocolor and composite images的概念。

使用File > Import > Image Sequence...打開您的tiff文件作爲堆棧。 您可能需要使用Image > Hyperstacks > Stack to Hyperstack...才能將您的堆棧轉換爲2通道10片超音攻。 然後使用Image > Stacks > Z Project...創建z投影。

使用macro recorder在執行這些命令會給你的代碼（需要automate任務）：

run("Image Sequence...", "open=/path/to/your/files file=tiff sort"); 
run("Stack to Hyperstack...", "order=xyczt(default) channels=2 slices=10 frames=1 display=Color"); 
run("Z Project...", "projection=[Average Intensity]");