在MATLAB中簡單的並行執行

Question

我已經想出了一些加速我的MATLAB代碼的很棒的方法：vectorizing，arrayfun，基本上只是擺脫for循環（不使用parfor）。我想把它帶到下一步。

假設我有2個函數調用是計算密集型的。

x = fun(a); 
y = fun(b); 

他們是完全獨立的，我想在並行而不是串行運行它們。我沒有並行處理工具箱。任何幫助表示讚賞。

感謝

Answer 1

如果我很樂觀，我認爲你問「我怎麼能簡單地做並行處理在Matlab」。在這種情況下，答案可能是：

並行處理最容易通過parallel computing toolbox完成。這使您可以訪問諸如parfor之類的內容。

我想你可以這樣做：

parfor t = 1:2 
    if t == 1, x = fun(a); end 
    if t == 2, y = fun(b); end 
end 

當然也有other ways，但應該是最簡單的。

Answer 2

MATLAB解釋器是單線程的，因此跨MATLAB函數實現並行性的唯一方法是運行MATLAB的多個實例。並行計算工具箱爲您完成這一任務，並以PARFOR/SPMD/PARFEVAL等形式爲您提供方便的界面。您可以手動運行多個MATLAB實例，但您可能需要做相當一部分工作來組織工作你想要完成。

Answer 3

通常的例子涉及parfor，這可能是從MATLAB的並行計算工具箱（PCT）中獲得並行性的最簡單方法。 parfeval功能非常簡單，如this other post所示。 PCT較少討論的功能是jobs和tasks的系統，對於兩個完全獨立的函數調用的簡單情況，這可能是最合適的解決方案。擾流板：batch命令可以幫助簡化簡單作業的創建（請參閱本文的底部）。

不幸的是，它並不像實施那樣簡單;爲了完整起見，這裏有一個例子：

% Build a cluster from the default profile 
c = parcluster(); 

% Create an independent job object 
j = createJob(c); 

% Use cells to pass inputs to the tasks 
taskdataA = {field1varA,...}; 
taskdataB = {field1varB,...}; 

% Create the task with 2 outputs 
nTaskOutputs = 2; 
t = createTask(j, @myCoarseFunction, nTaskOutputs, {taskdataA, taskdataB}); 

% Start the job and wait for it to finish the tasks 
submit(j); wait(j); 

% Get the ouptuts from each task 
taskoutput = get(t,'OutputArguments'); 

delete(j); % do not forget to remove the job or your APPDATA folder will fill up! 

% Get the outputs 
out1A = taskoutput{1}{1}; 
out1B = taskoutput{2}{1}; 

out2A = taskoutput{1}{2}; 
out2B = taskoutput{2}{2}; 

這裏的關鍵是給createTask作爲任務對象創建評估功能的功能myCoarseFunction。這可以是你的fun或者一個包裝器，如果你有複雜的輸入/輸出可能需要一個結構容器。

注意，對於單個任務，上面創建作業和任務，然後用submit開始他們的整個工作流程可以簡化了batch如下：

c = parcluster(); 
jobA = batch(c, @myCoarseFunction, 1, taskdataA,... 
    'Pool', c.NumWorkers/2 - 1, 'CaptureDiary', true); 

另外，請記住，與matlabpool（現在稱爲parpool）一樣，使用parcluster需要時間來啓動將執行作業的MATLAB.exe進程。