合併data.frames導致錯誤

Question

我想合併兩個數據集。兩者具有相同的ID，具有不同結果的相同行

data<-read.table(file="file.profile", header=T) 
data$PHENO<-data$PHENO-1 
data$ID<-paste(data$FID,":",data$IID, sep="") 

> head(data) 
     FID IID PHENO CNT CNT2 SCORE ID 
    1 FID1 10  0 10000 100 0.01 FID1:10 
    2 FID2 10  0 10000 100 0.01 FID2:10 

> cov<-read.table(file="cov.txt", header=T) 
> cov$ID<-paste(cov$FID,":",cov$IID, sep="") 

> head(cov) 
    FID IID COV1 COV2 COV3 COV4 COV5 COV6 COV7 PHENO ID 
1 FID1 10 0 0 0.101 0.10 0.22 2 179  222 FID1:10 
2 FID2 10 0 0 0.102 0.10 0.23 2 176  222 FID2:10 

> data<-merge(cov,data,by.x="ID", by.y="ID", all=T) 

> head(data) 
     ID FID.x IID.x COV1 COV2 COV3 COV4 COV5 COV6 COV7 PHENO.x 
1 FID1:10 FID1 10 0 0 0.101 0.10 0.22 2 179  222 
2 FID2:10 FID2 10 0 0 0.102 0.10 0.23 2 176  222 
    FID.y IID.y PHENO.y CNT CNT2  SCORE 
    FID1 10  0 10000 100 0.01 
    FID2 10  0 10000 100 0.01 

爲什麼我將「.x」和「.y」添加到我的列中？我怎樣才能避免這種情況？

非常感謝

Answer 1

如果兩個數據幀都相同名字列，merge()，將添加x或y的列名，以確定從哪個數據集他們來到。

在這裏，您在data和cov中都有一個名爲FID和IID的列;結果，FID.x和IID.x來自cov數據幀，而FID.y和IID.y來自data數據幀。

您可以通過在兩個數據集中都有唯一的列名來避免這種情況。