MRREL上的NIH UMLS數據模型

我正在使用本地MySQL副本中的統一醫療語言系統（UMLS）數據庫。我目前正試圖通過這個網頁瞭解數據結構：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK9685/MRREL上的NIH UMLS數據模型

我試圖識別CUI2中的概念。然而，我很困惑這個結果：

SELECT y.* FROM mrrel r INNER JOIN mrconso y ON r.cui2 = y.CUI;

只有1個結果。而不是瘋狂地猜測 - 它是我的sql嗎？這是表格上的錯誤嗎？我誤解了這個模式嗎？ - 我真的很感謝UMLS社區的一些反饋。如何正確地將MRREL.cui2鏈接到數據庫中的其他表？有沒有發佈完整的數據模型？

謝謝！

來源

2015-06-27 Brian Dolan

對於後人，我發現了一條線索。 MRREL，MRSTY和MRSCONSO表在CUI字段中都有前導「\ n」字符。在MRREL中只在CUI1中，而不在CUI2中。如果解決了問題，我會再次發表評論。我通過使用http://stackoverflow.com/questions/1504962/how-to-remove-new-line-characters-from-data-rows-in-mysql –

布賴恩，

不知道你是如何創建子什麼，我修改您的查詢了一下，跑了反對從2015AA發佈全Metathesaurus子集。 SELECT count(DISTINCT y.cui) FROM mrrel r INNER JOIN mrconso y ON r.cui2 = y.CUI ; 我收回了3074046個獨特的CUI。也許你可以給我發送你的mmsys.log文件，以確保你的子集正確完成？此外，您可以使用幾個ER圖和sample queries on our website，這可以幫助理解RRF數據模型。另外，您的MRREL表中有多少行總數？

來源

2015-06-27 21:21:25 user3653270

解決了這個問題，我在2015AA上運行。 mrrel中有27,612,106。這個查詢仍然沒有帶來什麼，但我確保我沒有更多的前導/尾隨字符。 –

另一個線索，MRCONSO表除了一個CUI外，都是bit_length 56，其中只有一個MRSTY的CUI2大於56. select count(*) from mrrel where bit_length(cui2) > 56;與之一起玩的只有MRCONSO.CUI中的一個與MRSTY.CUI2匹配。恐怕我不瞭解數據模型。 –

在user3653270的幫助下，我做了一個完整的重新安裝。換行符和位長問題已得到糾正。 –

MRREL上的NIH UMLS數據模型

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