我使用R包Momocs
來比較ImageJ中描繪的形狀輪廓,並將其保存爲二進制圖像tiff。例如:one outline of snail teeth。 Momocs需要一個X和Y座標矩陣,而且我無法將圖像轉換爲座標。一方面:ImageJ可以選擇另存爲... XY座標,但這隻適用於選擇。我可以使用魔杖工具選擇輪廓,但它包圍了一個像素寬的輪廓,例如直線將具有長矩形的座標,描述該線的兩側。這讓我看到我的蝸牛牙齒在double-vision (image example of one tooth close-up),並可能對分析產生不利影響。另一方面:Momocs有一個import_jpg1
命令,但是當我將圖像轉換爲jpegs(或從頭開始製作jpegs)時,它們最終會在輪廓周圍留下淺色像素作爲噪點。我嘗試了包tiff
和rtiff
,但是它們的輸出不是tiff黑色部分的XY座標,我對輸出不熟悉,不知道如何將它們轉換爲XY座標。如何加載保存爲tiff文件的二進制輪廓的XY座標?
誰能幫我做這些事情之一(或多個!):
- 上傳的TIFF至R的格式
Momocs
可以讀通過tiff
或rtiff
上傳 - 轉換TIFF數據轉換成格式
Momocs
可以閱讀 - 獲取XY矩陣座標在 值圖像TIFF全黑像素的
- 轉換二進制圖像以TIFF一個二進制圖像jpeg
在此先感謝您的幫助!