Pytables表D型排列

Question

如果我創建以下對準 numpy的陣列

import numpy as np 
import tables as pt 
numrows = 10 
dt = np.dtype([('date', [('year', '<i4'), ('month', '<i4'), ('day', '<i4')]), 
       ('apples', '<f8'), 
       ('oranges', '|S7'), 
       ('pears', '<i4')], align=True) 
x = np.zeros(numrows, dtype=dt) 
for d in x.dtype.descr: 
    print d 

和打印dtype.descr我得到如下：

('date', [('year', '<i4'), ('month', '<i4'), ('day', '<i4')]) 
('', '|V4') 
('apples', '<f8') 
('oranges', '|S7') 
('', '|V1') 
('pears', '<i4') 

的D型包括這些多餘的空隙「| V4 '，'| V1'

現在，當我使用相同的dtype（Numpy flavor）創建一個Pytable->表時，看起來我失去了對齊。

h5file = pt.open_file('mytable.h5', mode='w') 
table = h5file.create_table('/', 'mytable', dt, filters=None, expectedrows=numrows, byteorder='little') 
policy = table.row 

for j in xrange(numrows): 
    for field in table.colnames: 
     if (field == 'date'): 
      policy[field] = (2014, 1, 8) 
     else: 
      policy[field] = 0 
    policy.append() 

table.flush() 
mytable = h5file.root.mytable[:] 
h5file.close() 
for d in mytable.dtype.descr: 
    print d 

它的輸出是：

('date', [('year', '<i4'), ('month', '<i4'), ('day', '<i4')]) 
('apples', '<f8') 
('oranges', '|S7') 
('pears', '<i4') 

沒有更多的 '| V' 空間

我怎樣才能構建一個Pytable->表使得對準被保留（保持' | V'空格）？

Answer 1

PyTables默認不支持列的numpy void數據類型 - 請參閱tables.descr_from_dtype()的源代碼。但是，您可能可以通過用uint8s替換空白來誘使PyTables進入工作狀態。這看起來像這樣：

dt = ... 
expanded_dt = np.dtype(dt.descr) 
newdt = [] 
for name, col in zip(expanded_dt.names, expanded_dt): 
    if np.issubdtype(col, np.void): 
     newdt.append([name, np.uint8(col.itemsize)]) 
    else: 
     newdt.append([name, col]) 


newdt = np.dtype(newdt) 

這將放在具有正確寬度的假列中。