如何使用Ruby將多個CSV文件合併爲一個大的CSV文件？

Question

我一直在使用SmarterCSV將bed格式文件轉換爲csv文件並更改列名稱。

現在我已經收集了幾個CSV文件，並且希望將它們合併爲一個大的CSV文件。

在test3.csv，有三列，chromosome，start_site和end_site將被使用，而其他三個列，binding_site_pattern，score和strand該將被移除。

通過增加三個新列到test3.csv文件時，數據都在transcription_factor列都一樣：Cmyc，在cell_type列：PWM，在project_name列：JASPAR。

任何人對此有任何意見？

test1.csv

transcription_factor,cell_type,chromosome,start_site,end_site,project_name 
Cmyc,GM12878,11,809296,809827,ENCODE 
Cmyc,GM12878,11,6704236,6704683,ENCODE 

test2.csv

transcription_factor,cell_type,chromosome,start_site,end_site,project_name 
Cmyc,H1ESC,19,9710417,9710587,ENCODE 
Cmyc,H1ESC,11,541754,542137,ENCODE 

test3.csv

chromosome,start_site,end_site,binding_site_pattern,score,strand 
chr1,21942,21953,AAGCACGTGGT,1752,+  
chr1,21943,21954,AACCACGTGCT,1335,- 

希望的組合的結果：

transcription_factor,cell_type,chromosome,start_site,end_site,project_name 
Cmyc,GM12878,11,809296,809827,ENCODE 
Cmyc,GM12878,11,6704236,6704683,ENCODE 
Cmyc,H1ESC,19,9710417,9710587,ENCODE  
Cmyc,H1ESC,11,541754,542137,ENCODE 
Cmyc,PWM,1,21942,21953,JASPAR 
Cmyc,PWM,1,21943,21954,JASPAR 

Answer 1

hs = %w{ transcription_factor cell_type chromosome start_site end_site project_name } 

CSV.open('result.csv','w') do |csv| 
    csv << hs 
    CSV.foreach('test1.csv', headers: true) {|row| csv << row.values_at(*hs) } 
    CSV.foreach('test2.csv', headers: true) {|row| csv << row.values_at(*hs) } 
    CSV.foreach('test3.csv', headers: true) do |row| 
    csv << ['Cmyc', 'PWM', row['chromosome'].match(/\d+/).to_s] + row.values_at('start_site', 'end_site') + ['JASPAR'] 
    end 
end