如何在h5py中將比例（或物理尺寸）分配給HDF5數據集？

Question

我想通過h5py將科學數據導出爲HDF5容器格式，以供其他軟件讀取。

我有一個7維numpy數組，我通過h5py.File.create_dataset（）創建了一個數據集。這工作正常。

但是，我找不到任何方法來爲h5py中的這7個維度指定任何物理比例（比如米，公斤，角度等）。我找不到有關如何執行此操作的任何文檔。

這是根據HDF5 reference可能的。

這是在h5py中實現的嗎？我知道HDF5是可能的。

感謝您的幫助！

Answer 1

你可能需要一個屬性：

http://code.google.com/p/h5py/wiki/HowTo#Reading_and_writing_attributes 

Answer 2

在HDF5維度量表只是與您的第一個數據集相關聯的其他數據集。例如，它們可以用來定義空間座標。如果要指示特定維度具有某些物理單位，則可以使用HDF5尺寸標註API對維度進行標註：H5DSset_label()。

Dimension scales可能在h5py中，使用h5py.dims.create_scale()和h5py.dims.attach_scale()和h5py.dims.label來設置標籤。

例如，以指示的foo.dat:/data第一尺寸是以kg和以米爲第二，可以按如下方式設置的標籤（帶f作爲HDF5文件）：

f['data'].dims[0].label = 'kg' 
f['data'].dims[1].label = 'm' 

要添加數據集作爲一個高度規模，第二個維度，您首先需要創建一個規模，然後再連接數據集：

f['data'].dims.create_scale(f['h'], 'height') 
f['data'].dims[1].attach_scale(f['h']) 

可以再用

訪問標籤3210

[dim.label for dim in f['data'].dims] 

和維度量表自己與

f['data'].dims[1][0] 

或

f['data'].dims[1]['height']