我可以在不使用逆時獲得一個龍對象的總長度嗎？

Question

讓我們說我有一個RLE像這樣，長度爲10：

b = rle(c("H", "T", "T", "H", "H", "H", "H", "H", "T", "H")) 

我怎樣才能得到這個對象的長度不使用inverse.rle？

length(inverse.rle(b)) 
# 10 

我有一些稀疏的Rles代表染色體，他們可以有數以百萬計的長度，所以我寧願不使用逆。

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akruns回答我的數據不起作用：

> a 
$ mydata 
numeric-Rle of length 57442693 with 12471 runs 
    Lengths: 2709826  100 31062  100 ...  2  232  100  47 
    Values :  0  1  0  1 ...  1  0  1  0 

> a$lengths 
NULL 

Answer 1

由於rle是list物體lengths和values爲list的元素，我們可以提取lengths和sum

sum(b$lengths) 
#[1] 10 

Answer 2

關於你的編輯：akrun的回答仍然通常工作，你只需要稍微適應你Rle數據類型：

我不知道你正在使用在這裏，但萬一這就像Bioconductor的Rle S4類什麼什麼功能，該解決方案將

sum(s@lengths) 

也就是說，代替嵌套的名稱lengths你必須使用S4插槽名稱lengths。更一般地說，您可以通過檢查找出哪個解決方案有效：

1. 對象名稱通過names(obj)。
2. 或者，在S4對象的情況下，其插槽名稱爲：slotNames(obj)。

Answer 3

對於S4vectors類Rle您需要使用方法runLength，它沒有訪問$length。

在我上面的例子中，這成爲runLength(a[[1]])。