getblast錯誤unavilable matlab

Question

我正在寫matlab代碼，它應該遍歷列表序列並每次爆炸。這裏是代碼的相關部分：

%blast the seq 

[res, ROTE] = blastncbi(seq, 'blastn'); 
res1 = getblast(res, 'WaitTime',ROTE); 
resName = res1.Hits(1).Name 

一些序列的，它的工作，然後最後它給了我此錯誤消息：

Error using getblast (line 176) 
BLAST V7EBUE0901R is unavailable - try later. 

請注意，我定義ROTE爲'WaitTime'的值，正如在這個函數的文檔中所建議的那樣。

腳本必須遍歷很多很多的基因，所以我不能讓它每五分鐘就會崩潰！

Answer 1

RTOE返回blastncbi是估計時間需要多長時間。也許估計有時是不正確的。

兩個簡單的方法來解決這個問題，可以等待更長的時間，或者試圖兩次：

res1 = getblast(res, 'WaitTime',ROTE*10); 

或

try 
    res1 = getblast(res, 'WaitTime',ROTE); 
catch 
    res1 = getblast(res, 'WaitTime',ROTE); 
end 

當然，這假定您確認信息，您的要求實際上是可用的。