R中的命令行參數

Question

我想知道是否可以傳遞一個字符串作爲命令行參數在R中執行？

我已經嘗試它，我認爲它是基於空間的解析，無論引號。

./R_Script.r abc.bed def.bed "cat bedgraph 1,2" 

Answer 1

它不應該基於空間解析。我也不確定你爲什麼試圖直接執行你的R腳本文件，而不是使用Rscript並傳遞腳本文件。如果您R_Script.r文件只包含一個行：commandArgs()，然後運行該行：

Rscript --vanilla R_Script.r "first second" 

應該讓你：

[1] "/usr/local/lib/R/bin/exec/R" "--slave" 
[3] "--no-restore"    "--vanilla" 
[5] "--file=R_Script.r"   "--args" 
[7] "first second" 

正如你可以看到，該列表的第七元素是first second，所以它不解析空間。