腳本無法找到從qsub羣集腳本運行時的目錄/文件

Question

我從qsub shell腳本調用了一些python腳本中的幾個unix命令和python，意圖在羣集上運行。問題在於，當腳本執行時，shell中的某些內容似乎會出錯，從而找不到存在的目錄和文件。例如，在qsub的.out輸出文件中，我看到以下錯誤：

cd: /valid/dir/name: No such file or directory 
python valid/script/name.py 
python: can't open file 'valid/script/name.py': [Errno 2] No such file or directory 

所以腳本無法cd到一個絕對存在的目錄中。同樣，在絕對存在的python腳本上調用python會產生錯誤。

任何想法這裏可能會出現什麼問題，或者我怎麼可以嘗試調試呢？

非常感謝。

Answer 1

這些錯誤是非常明顯的。確保/valid/dir/name實際上是一個目錄。如果找不到，你可以把它放在你的shell腳本中來創建這個目錄。

if [ ! -d "/valid/dir/name" ];then 
    mkdir -p /valid/dir/name 
fi 

至於Python錯誤，因爲沒有「有效」的目錄，它會給你錯誤。

Answer 2

此目錄是否存在於每個可能的計算節點上？請記住，腳本不一定會在您提交的主機上執行。嘗試將等同於echo hostname的python添加到腳本中，然後驗證該主機上是否存在該目錄。