2012-03-17 25 views
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我需要在內存中保存和查找一百萬個均勻分佈的整數。 我的工作量非常強烈。
我目前的實現使用HashSet(Java)。我看到很好的查找性能,但內存使用情況並不理想(幾十MB)。
你能想到更高效的(內存)數據結構嗎?
編輯:該解決方案將需要支持少量的數據結構添加。通過大量(均勻分佈式)整數來存儲和查找空間高效的數據結構

背景:
上述整數問題如下問題簡單化:
我有一套100萬的字符串(我的「說文解字」),我想告訴字典是否包含給定的字符串,或不。
字典太大而不適合內存,所以我願意犧牲一點精度來減少內存佔用。我將通過切換到包含每個字符串的哈希碼值(整數)的字典而不是實際的字符來實現。我假設每個字符串發生碰撞的可能性僅爲1M/2^32

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可能是一個[布隆過濾器]的作業(http://en.wikipedia.org/wiki/Bloom_filter)? – 2012-03-17 21:28:50

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你需要一個'insert'操作還是一次構建的字典,並且在查找過程中不再修改? – 2012-03-17 21:34:30

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@Gareth Rees:你爲什麼不把它作爲答案發布,因此可以提高? – meriton 2012-03-17 21:47:36

回答

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聽起來像你可以只是保持排序int[],然後做二進制搜索。擁有一百萬的價值觀,即20個比較來達到任何價值 - 會不會足夠快?

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但是這應該與HashSet具有相同的內存佔用空間,不是嗎? – user949300 2012-03-17 21:22:27

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@ user949300:不,因爲'HashSet'必須爲每個值分配一個Integer對象(大小差異很大!),*和*它不會像我建議的*和*那樣密集填充,它將不得不爲每個值保留哈希碼*,*它將爲每個值(它將包含哈希碼,當然,因此有點重複計數)具有一個「Entry」對象。當然,所有這些都會讓緩存更加糟糕,同時也會佔用更多的內存。 – 2012-03-17 21:25:49

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@ user949300不,HashSet由HashMap支持,並且有很多空單元,這取決於您存儲的實際值。 – Jochen 2012-03-17 21:25:53

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對於可用的基元有一些IntHashSet實現。

快速谷歌搜索了我this one。還有一個Apache的[開源]實現IntHashSet。我更喜歡apache實現,雖然它有一些開銷[它被實現爲IntToIntMap]

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您可能想看看BitSet Lucene中使用的那個更像標準Java實現,因爲它更快忽略了一些標準的邊界檢查。

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我的第一個迴應wqas一個位集,但後來認識到,由於散列碼高達2^31,如果包括非常低的值(接近0)和大(接近MAXINT),大小可能是巨大的。 Alsom,你需要兩個Bitset,一個用於正數,一個用於負數,一個用於負數 – user949300 2012-03-18 03:04:45

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@ user949300,如果你需要兩個BitSets,那麼每個將保存一半位,並且存儲2^32位需要2^29個字節 - 大但不是不可能。我認爲布盧姆過濾器從不同的答案將是一個更好的解決方案,因爲它可以實現更低的內存使用率和更高的拒絕誤報率。 – 2014-12-17 22:19:32

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儘管Jon Skeet的回答爲小投資節省了很多錢,但我認爲你可以做得更好。既然你的數字是相當均勻分佈的,你可以使用內插搜索來更快的查找(大概O(log log N)而不是O(log N))。對於一百萬個項目,您大概可以計劃大約4個比較,而不是大約20個。

如果您想再做一點工作以將內存(大致)再次削減一半,則可以將其構建爲兩個級查找表,基本上是一種簡單版本的trie。

enter image description here

你會打破你的(大概)32位整數分成兩個16位部分。您將使用前16位作爲查找表第一級的索引。在這個級別上,你會有65536個指針,每個可能的16位值用於你的整數部分。那會帶你到桌子的第二層。對於這一部分,我們將在所選指針和下一個指針之間進行二進制或內插搜索 - 即第二級中所有在前16位具有相同值的值。然而,當我們查看第二個表格時,我們已經知道該值的16位 - 因此,不是存儲該值的所有32位,我們只需要存儲該值的其他012位數據的其他012位存儲器位。

這意味着,而不是第二級佔用4兆字節,我們已經減少到2兆字節。除此之外,我們需要第一級表,但它只有65536x4 = 256K字節。

這幾乎肯定會提高整個數據集二進制搜索的速度。在最壞的情況下(使用二進制搜索第二級),我們可以進行多達17次比較(1 + log 65536)。但平均值會比這更好 - 因爲我們只有一百萬個項目,所以每個第二級「分區」中的平均值只能是1_000_000/65536 =〜15個項目,給出大約1 + log ( 16)= 5比較。在第二級使用內插搜索可能會進一步減少這一點,但是當您僅從5次比較開始時,就沒有太多餘地進行真正的重大改進。由於第二級平均只有15個項目,所以你使用的搜索類型不會有太大的變化 - 即使是線性搜索也會非常快。

當然,如果你想要更進一步,可以使用4級表(而不是整數中的每個字節)。然而,這是否會爲你節省更多的費用以避免麻煩,這是值得商榷的。至少從目前來看,我的猜測是你會做相當多的額外工作以節省很少的成本(只是存儲百萬個整數的最後一個字節顯然佔用1兆字節,並且三個級別的表導致了這一點佔用相當多的金額,所以你可以將數量增加一倍,以節省大約半個兆字節的數量。如果你處於一個稍微節省一點的情況下會產生巨大影響的情況,那就去做吧 - 但除此之外,我懷疑返回是否會證明額外投資。

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確實很好的優化。我想,一旦我的數據量增加了一個/兩個數量級,它就會派上用場。 – 2012-03-19 22:42:54

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如果你願意接受一個假陽性的可能性很小,以換取內存使用量的大量減少,那麼Bloom filter可能正是你所需要的。

布隆過濾器由組成k散列函數和n的表,位,最初爲空。要將一個項目添加到表格中,請將其饋送到散列函數(獲取0到之間的數字),並設置相應的位。要檢查某個項目是否在表格中,請將其送入每個散列函數,並查看是否設置了所有對應的位。

具有1%誤報率的布隆過濾器需要每個項目大約10位;隨着每個項目添加更多位數,誤報率會迅速下降。

Here's an open-source implementation in Java.

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我認爲你可能會重新考慮原來的問題(有效率的單詞列表),而不是試圖優化「optimalization」。

我會建議看着基數樹/ Trie。

https://en.wikipedia.org/wiki/Radix_treehttps://en.wikipedia.org/wiki/Trie

你基本上存儲某種樹用繩子的前綴,每個分支有在字典中的選擇時間。它有一些有趣的副作用(可以非常有效地對前綴進行過濾),可以爲具有較長公共前綴的字符串節省一些內存,並且速度相當快。

Radix tree example

一些示例實現:

https://lucene.apache.org/core/4_0_0/analyzers-stempel/org/egothor/stemmer/Trie.html

https://github.com/rkapsi/patricia-trie

https://github.com/npgall/concurrent-trees

有各種實現對業績比較有意思這裏,有更大的重點,而不是存儲ü聖人,但它可以是有益的還是

http://bhavin.directi.com/to-trie-or-not-to-trie-a-comparison-of-efficient-data-structures/

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