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基本上,是否有可能讓scipy.ndimage.map_coordinates
返回一個多值結構,而不僅僅是一個標量?我希望能夠插入一次以在一個點上檢索5個值,而不是必須插入5次。從`scipy.ndimage.map_coordinates`輸出向量/數組
這是我在MWE上的嘗試,以證明問題。我將從一個標量的3D插值開始。現在我不會在點之間,因爲那不是重點。
import numpy as np
from scipy import ndimage
coords = np.array([[1.,1.,1.]])
a = np.arange(3*3*3).reshape(3,3,3)
ndimage.map_coordinates(a,coords.T) # array([13.])
現在,假設我要a
有對價值的,不只是一個。我的直覺是
a = np.arange(3*3*3*2).reshape(3,3,3,2)
a[1,1,1] # array([26.,27.])
ndimage.map_coordinates(a[:,:,:],coords.T) # I'd like array([26.,27.])
而是期望的輸出,我得到如下:
RuntimeError Traceback (most recent call last)
(...)/<ipython-input-84-77334fb7469f> in <module>()
----> 1 ndimage.map_coordinates(a[:,:,:],np.array([[1.,1.,1.]]).T)
/usr/lib/python2.7/dist-packages/scipy/ndimage/interpolation.pyc in map_coordinates(input, coordinates, output, order, mode, cval, prefilter)
287 raise RuntimeError('input and output rank must be > 0')
288 if coordinates.shape[0] != input.ndim:
--> 289 raise RuntimeError('invalid shape for coordinate array')
290 mode = _extend_mode_to_code(mode)
291 if prefilter and order > 1:
RuntimeError: invalid shape for coordinate array
我找不到任何結構(a
,coords
等的形狀的排列),這給了我正在尋找的答案。另外,如果有比使用map_coordinates
更好的方法,請繼續。我認爲scipy.interpolate.interp1d
可能是要走的路,但我找不到任何文檔或者它可能會做什麼的暗示...
感謝這個片段。不幸的是,我開始使用'map_coordinates'的主要原因是它可以很好地擴展到大型數據集中。目前,我的實驗網格是488x101x3,但它會增長到至少488x101x11x6x7,在這種情況下,這種方法似乎很慢。除非它可以變成某種插入器對象或什麼東西? – Warrick
'map_coordinates'可能部分取決於其網格是均勻間隔的事實,這使得插值更便宜。這裏的另一個問題是,如果你想在單個分散點上而不是在新的網格上評估函數,迭代的interp1d解決方案不會削減它,因爲它每次調用時都會重新計算樣條係數。張量產品樣條(迭代interp1d是一個實例)可以預先計算,評估AFAIK並不困難,但我不知道Python的現有N-d實現(除map_coordinates之外)。 –