使用matplotlib繪製大圖時節點大小和顏色的錯誤

我正在用networkx繪製大圖，並且當圖大時我遇到了問題。對於小圖，一切正常，但對於大圖（1k節點），分配顏色和大小似乎失敗。這是有問題的代碼段使用matplotlib繪製大圖時節點大小和顏色的錯誤

H=nx.connected_component_subgraphs(G)[0] 
d=nx.degree(H) 
b=nx.eigenvector_centrality(H) 
pos2=nx.spring_layout(H,scale=2) 

labels={} 
colors={} 
dim={} 

for n in H.nodes(): 
    i=0 
    for v in b: 
     if v==n: 
      break 
     i+=1 
    colors[n]=b.values()[i] 
    j=0 
    for w in d: 
     if w==n: 
      break 
     j+=1 
    dim[n]=d.values()[j]*40 

    k=0 
    for z in range(2): 
     if n in sorted(b.items(), key=lambda x:x[1],reverse=True)[z]: 
      labels[n]=n 


nx.draw(H, 
      pos2, 
      with_labels=False, 
      node_size=dim.values(), 
      node_color=colors.values(), 
      cmap=plt.cm.Reds, 
      vmin=min(b.values()), 
      vmax=max(b.values()) 
)

，因爲我沒有足夠的聲譽，我不能發表圖片，但是當我說，它沒有我的意思是（部分）低的連接節點是更大然後具有高連接性的節點，並且顏色也是如此。

想知道它是怎麼回事？

enter image description here

來源

2014-02-17 imabug

把它們放在一些地方，幷包括一個鏈接。高級用戶並將其編輯到您的帖子中。 – tacaswell

這裏是小圖示例https://www.dropbox.com/s/sgwiop394cgik7j/ex1.png 和她的大變焦 https://www.dropbox.com/s/paustbt0wci75cl/ex2 .png – imabug

所以SO似乎不喜歡下拉框鏈接..... – tacaswell

傳遞關鍵字節點列表=你想要繪製的節點。然後使用相同的順序在列表中將顏色和大小設置爲node_color和node_size參數。

nodes = H.nodes() 

nx.draw(H, pos2, nodelist=nodes, 
     node_size = [dim[n] for n in nodes], 
     node_color= [colors[n] for n in nodes], 
     cmap=plt.cm.Reds, 
     vmin=min(b.values()), 
     vmax=max(b.values()), 
     with_labels=False 
)

來源

2014-02-19 00:35:43 Aric

使用matplotlib繪製大圖時節點大小和顏色的錯誤

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