rpy2在ubuntu上得到「NotImplementedError：從rpy2 DataFrame轉換爲pandas'DataFrame」的測試

Question

如果有人可以幫助我，我會非常感激。

我在ubuntu 13.10上安裝了python 2.7，R 3.0.1，我已經按照rpy2安裝指南成功完成了測試。

使用此命令時python -m 'rpy2.tests'我碰到下面的錯誤運行通過提示測試：

rpy2 version: 2.3.8 
built against R version: 3-0.1--62743 
............................................................................................ ............................................................................................ .........................................................................................................E........................................................... 
====================================================================== 

ERROR: testPandas2ri 
(rpy2.robjects.tests.testPandasConversions.PandasConversionsTestCase) 
---------------------------------------------------------------------- 
Traceback (most recent call last): 
    File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/rpy2/robjects/tests/testPandasConversions.py", line 74, in testPandas2ri 
    pandas_df = robjects.conversion.ri2py(rdataf) 
    File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/rpy2/robjects/pandas2ri.py", line 63, in ri2pandas 
    raise NotImplementedError("Conversion from rpy2 DataFrame to pandas' DataFrame") 
NotImplementedError: Conversion from rpy2 DataFrame to pandas' DataFrame 

---------------------------------------------------------------------- 
Ran 349 tests in 4.297s 

我在Python解釋器安裝時，得到同樣的錯誤。我在哪裏可以找到這個轉換包裝？

Answer 1

看起來這個代碼目前有點不穩定。顯然，有很多人（包括我自己）使用rpy2和熊貓，但rpy2還沒有一個穩定的內置轉換器。你可以嘗試this module在rpy2當前開發版本：

from rpy2.robjects.pandas2ri import pands2ri 
rpy2.robjects.pandas2ri.activate() 

它看起來像上面的代碼尚未穩定基於源代碼註釋，所以你可能是最好關閉編寫基於關閉自己的代碼的功能在該模塊中。

你也可以嘗試熊貓的代碼。在這裏看到的熊貓/ rpy2接口（其實際上已經被更新自此文檔被寫入）的文檔：

http://pandas.pydata.org/pandas-docs/dev/r_interface.html

和源代碼：

https://github.com/pydata/pandas/blob/master/pandas/rpy/common.py

例如：

import pandas.rpy.common as com 
r_dataframe = com.convert_to_r_dataframe(df) 

隨意問你一個問題，你遇到的具體問題如果你不能 想辦法。