無法訪問返回的h5py對象實例

Question

我在這裏有一個非常奇怪的問題。我有兩個函數：一個讀取使用h5py創建的HDF5文件，另一個創建連接前一個函數返回的內容的新HDF5文件。

def read_file(filename): 
    with h5py.File(filename+".hdf5",'r') as hf: 

     group1 = hf.get('group1') 
     group1 = hf.get('group2')    
     dataset1 = hf.get('dataset1') 
     dataset2 = hf.get('dataset2') 
     print group1.attrs['w'] # Works here 

     return dataset1, dataset2, group1, group1 

而創造現在的問題是，該數據集，並從創建和WD1，WD2，WG1和WG2爲代表的新文件的屬性可以通過我訪問的文件功能

def create_chunk(start_index, end_index): 

    for i in range(start_index, end_index): 
     if i == start_index: 
      mergedhf = h5py.File("output.hdf5",'w') 
      mergedhf.create_dataset("dataset1",dtype='float64') 
      mergedhf.create_dataset("dataset2",dtype='float64') 

      g1 = mergedhf.create_group('group1') 
      g2 = mergedhf.create_group('group2') 

    rd1,rd2,rg1,rg2 = read_file(filename) 

    print rg1.attrs['w'] #gives me <Closed HDF5 group> message 

    g1.attrs['w'] = "content" 
    g1.attrs['x'] = "content" 
    g2.attrs['y'] = "content" 
    g2.attrs['z'] = "content" 
    print g1.attrs['w'] # Works Here 
return mergedhf.get('dataset1'), mergedhf.get('dataset2'), g1, g2 

def calling_function(): 
    wd1, wd2, wg1, wg2 = create_chunk(start_index, end_index) 
    print wg1.attrs['w'] #Works here as well 

和我可以訪問屬性數據，但我不能做相同的我已閱讀並返回的值。

當我返回對調用函數的引用時，任何人都可以幫助我獲取數據集和組的值嗎？

Answer 1

的問題是在read_file，這條線：

with h5py.File(filename+".hdf5",'r') as hf: 

這在with塊的結尾關閉hf，即當read_file回報。發生這種情況時，數據集和組也會關閉，您不能再訪問它們。

有（至少）兩種方法來解決這個問題。首先，就像你在create_chunk你可以打開文件：

hf = h5py.File(filename+".hdf5", 'r') 

，並保持參考hf只要身邊，你需要它，在關閉前：

hf.close() 

的另一種方式是複製從數據集的數據read_file並返回那些代替：

dataset1 = hf.get('dataset1')[:] 
dataset2 = hf.get('dataset2')[:] 

請注意，你不能用組做到這一點。只要您需要對羣組執行操作，該文件就需要打開。