PBS調度程序爲3個處理器的MPI程序分配相同的處理器

Question

我正在對具有8個節點並且每個具有Intel Xeon六核處理器的集羣進行MPI編程。我需要三個處理器來處理我的mpi代碼。

我使用qsub提交作業。當我使用「qstat -n」檢查哪些處理器正在運行時，它會顯示類似cn004/0 * 3的內容。

那麼這是否意味着它只在一個處理器上運行？

因爲它是不小於當我使用單個處理器加速（這是當域大小對於這兩種情況下是相同的）

我使用用於提交腳本如下

#! /bin/bash 
#PBS -o logfile.log 
#PBS -e errorfile.err 
#PBS -l cput=40:00:00 
#PBS -lselect=1:ncpus=3:ngpus=3 
#PBS -lplace=excl 
cat $PBS_NODEFILE 
cd $PBS_O_WORKDIR 
mpicc -g -W -c -I /usr/local/cuda/include mpi1.c 
mpicc -g -W mpi1.o -L /usr/local/cuda/lib64 -lOpenCL 
mpirun -np 3 ./a.out 

Answer 1

「qstat -n」它表示類似cn004/0 * 3。

問：那麼這是否意味着它只在一個處理器上運行？

簡短答案是「否」。這並不意味着它在一個處理器上運行。 「cn004/0 * 3」應解釋爲「該作業分配了三個cpu核心，如果我們將核心數量從0到5分配，則分配的核心將具有數字0,1和2」。

如果另一項工作在節點上運行，它將接收到下三個連續的數字「3,4和5」。在qstat -n輸出中，這看起來像「cn004/3 * 3」。

您使用指令place=excl來確保其他作業不會獲得節點，因此基本上所有六個核心都可用。

現在對於你的第二個問題：

問：它是不是比我使用一個處理器加快

爲了回答這個問題，我們需要知道的算法正確並行化。