pbs

1熱度

1回答

發送陣列PBS腳本

我有一個bash腳本，與幾個變量調用qsub： group=group_1 normals=$(IFS=,; echo *.txt) qsub -v VAR1=$group,VAR2=${normals[@]} [...] run_script.pbs run_script.pbs #PBS -l nodes=1:ppn=16 #PBS -l walltime=2:00:00 #PB

bash pbs 2017-09-13

---

1熱度

2回答

grep qstat輸出和複製文件一旦完成

我在我的羣集上使用PBS作業調度程序。在bash，我想監視作業狀態，一旦工作完成，我想複製結果到 特定位置（/數據/ MyFolder中/） 我qstat命令輸出如下： JobID Username Queue Jobname SessID NDS TSK Memory Time Status -----------------------------------------------

bash cluster-computing pbs 2017-06-14

---

1熱度

1回答

將SLURM批處理命令行參數傳遞給R

我試圖運行帶有各種參數的SLURM sbatch命令，這些參數可以在R腳本中讀取。當使用PBS系統時，我曾經寫過qsub -v param1=x,param2=y（+其他系統參數，如內存要求等，以及由PBS讀取的腳本名稱），然後在R腳本中用x = Sys.getenv(‘param1’)讀取它。 現在我試圖 sbatch run.sh --export=basePath=‘a’ 隨着run.s

r cluster-computing distributed-computing pbs slurm 2017-08-09

---

0熱度

1回答

從PBS作業中調用python腳本

如何調用python腳本以從pbs作業運行？ 更多的細節： 我目前有以下形狀的PBS文件的工作（這部分完美的作品，不應該被改變）： #!/bin/bash #PBS -N # work name #PBS -q #PBS -l #PBS -S /bin/bash #PBS -m ##PBS -M #my email cd $PBS_O_WORKDIR 我有那麼上面的計算中完成一個

python bash delay pbs qsub 2017-08-10

---

0熱度

1回答

扭矩安裝錯誤：@ SBINDIR @/trqauthd：沒有這樣的文件或目錄

我給下面的命令來安裝（以root登錄）的扭矩： ./configure make make install 在那之後，我嘗試使用運行轉矩守護： cp contrib/init.d/trqauthd.in /etc/init.d/trqauthd chkconfig --add trqauthd echo /usr/local/lib > /etc/ld.so.conf.d/torque

batch-processing job-scheduling pbs rhel6 torque 2017-08-10

---

0熱度

1回答

如何設置默認應用程序以打開日誌文件，儘管更改文件結尾（在MobaXterm中）？

如果文件結尾不斷變化，是否有方法可以爲這些日誌文件設置默認應用程序，即使是 ？ 我工作的MobaXterm，並通過* .pbs運行一些代碼文件後，我得到的形式錯誤和輸出日誌文件： sample_code.o23456 sample_code.e23456 當我打開日誌文件我我被要求設置一個默認的應用程序，並選擇一個應用程序來打開日誌文件。 下一次我執行它的文件結尾將有改變 sample_co

python windows logging ssh pbs 2017-06-22

---

0熱度

1回答

PBS批量作業提交

我有100個帶.bash擴展名的腳本，我想在pbs腳本中一次性提交所有這些腳本。我用 qsub * .bash 但它不工作。任何人都可以請幫我

pbs 2017-08-15

---

0熱度

2回答

鏈接陣列PBS作業

我試圖使用PBS高性能計算機作業調度器來鏈接兩個計算作業。我的腳本如下： 調用的腳本1.pbs： #!/bin/bash #PBS -N 1 #PBS -q thin #PBS -l walltime=0:03:00 #PBS -l select=1:ncpus=1 #PBS -j oe #PBS -J 1-10 cd $PBS_O_WORKDIR echo 'SCRIPT 1'

arrays bash hpc qsub pbs 2017-06-28

---

4熱度

1回答

喬布斯從運行狀態進入排隊和回

開關我們與轉矩PBS和毛伊島的羣集上一些工作觀察這個奇怪的現象：一些作業（R）unning和（Q）ueued狀態之間切換。嘗試谷歌周圍，並沒有發現任何提示。可能是什麼原因？值得注意的是，這些作業的性質不同：有些使用TensorFlow和python，另一些使用C++可執行文件。

cluster-computing pbs torque 2017-06-30

---

0熱度

1回答

Bash腳本和命令行參數

所以我有一個名爲「run_correlation_study.pbs」和「correlation_study.pbs」的文件。在correlation_study.pbs中，我運行一個使用便攜式批處理軟件（pbs）的bash腳本並分配3個命令行參數，這些參數將用於我的實際程序中。在run_correlation_study.pbs中，循環遍歷在correlation_study.pbs中使用的命令

c++ bash pbs 2017-07-12

---