我試圖在我的筆記本電腦(MacBook Pro 10.5.8,MPICH2-1.1)上安裝PETSc-3.2,並且在運行測試時遇到了一些困難:它從系統調用到getdomainname()
的錯誤返回了錯誤的地址。getdomainname()返回MPI下的錯誤地址(測試PETSc庫)
[-1]PETSC ERROR: --------------------- Error Message ------------------
[-1]PETSC ERROR: Error in system call!
[-1]PETSC ERROR: getdomainname()!
[-1]PETSC ERROR: ------------------------------------------------------
探討,我寫了下面的測試代碼使用和不使用MPI檢查的getdomainname()
功能:
單處理器:
#include <unistd.h>
#include <stdio.h>
#include <errno.h>
#include <string.h>
#include <limits.h>
#include <stdlib.h>
int main(int argc, char **argv)
{
char *name;
int namelen = CHAR_MAX;
name = (char*) calloc (namelen,sizeof(char));
int err = getdomainname(name,namelen);
printf("%s\n",strerror(errno));
printf("Domain name: %s\n",name);
return err;
}
並行:
/* Headers */
#include "mpi.h"
int main(int argc, char **argv)
{
MPI_Init(&argc,&argv);
int myrank;
char *mpi_name;
int mpi_namelen = MPI_MAX_PROCESSOR_NAME;
mpi_name = (char*) calloc (mpi_namelen,sizeof(char));
MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD,&myrank);
int mpi_err = MPI_Get_processor_name(mpi_name,&mpi_namelen);
printf("MPI_Get_processor_name [%d]: %s\n",mpi_err,mpi_name);
char *name;
int namelen = CHAR_MAX;
name = (char*) calloc (namelen,sizeof(char));
int err = getdomainname(name,namelen);
printf("%s\n",strerror(errno));
printf("Domain name: %s\n",name);
return err;
MPI_Finalize();
}
單處理器代碼沒有問題,並行代碼得到正確的n即使與mpirun -np 1
一起運行,也會返回getdomainname()
的錯誤地址。
有沒有人遇到過這樣的問題? mpirun
是否需要進行某種配置,以便爲MPI生成的每個進程設置域名?提前致謝!
更新:
對於運行到這個問題的PETSc,編譯選項--with-debugging=0
。似乎在一些PETSc調試消息中,他們使用getdomainname()
而不是MPI_Get_processor_name()
。在不調試的情況下編譯禁用庫中的這個分支。
這是x86_64還是IA-32系統? MPI編譯器和非MPI測試是否適用於不同的體系結構? –
好的通話,我甚至沒有想到!我的MPI編譯器自動使用'-m64'。我用'-m64'重新編譯了我的單處理器代碼,並且它停止工作了...是解決這個問題的一種方法,還是應該編譯所有沒有'-m64'的東西?請把它放在一個答案中。 – Mosby