修改dicom圖像並將其保存爲原始數據？

這裏是我正在嘗試修改dicom圖像像素的matlab數據。修改dicom圖像並將其保存爲原始數據？

dicom圖像是4D，3d爲Rgb圖像，其他維度代表fames。我採取每一幀，我修改了一些特定的像素值，我嘗試以原始格式保存整個dicom圖像數據。

我將它保存爲原始格式的原因是我想在dcmtk的dcmodify命令中將此數據用作文件。所以，我的第一個問題是，我是否以正確的格式保存原始數據？如果沒有，請告訴我應該怎麼做。此外，你知道dcmodify命令dcmtk是否可以像這種情況下處理4d數據，或者它只能修改一個單幀？謝謝。

clc 
clear all 
close all 
img=dicomread('Bad001_2CH_01_anon.dcm'); 
%%implay(img); 
[rows,columns,colors,frames]=size(img); 
for i=1:frames 
    img(1:25,:,:,i)=0; 
    disp(i); 
    figure(1) 
    imshow(img(:,:,:,i)) 
end 
fid=fopen('image.raw','w+'); 
cnt=fwrite(fid,img,'uint8'); 
fclose(fid);

來源

2013-02-21 the_naive

你可能想看看gdcmimg和或gdcmraw取決於你真正想做的事

來源

2013-02-27 15:34:53 malat

感謝您所說的話，它對於單幀dicom圖像已經非常有用，但是我還沒有設法使用多幀圖像。 – 2013-02-28 15:54:27

您可能希望在gdcmraw和/或gdcmimg之前運行第一個'gdcmconv --raw'。 – malat 2013-03-01 10:46:11

你不需要原始數據使用DMTK：「dcmodify is a tool that allows to modify, insert and delete tags and items in DICOM files.」

此外，原始數據是極少數和特定情況下理想的，因爲該文件中的一些元數據說的是在那裏，當程序讀取信息時，它的存儲方式會有很大的幫助。

我從來沒有用過dmkt，但我猜你應該讀與dicomread的數據（如你這樣做），修改（如你這樣做），然後將其與dicomwrite

要重新保存爲DICOM保留DICOM中的元數據，您還需要使用dicominfo來提取元數據，以便在保存文件時將其放回原處。

img = dicomread('originalfile.dcm'); 
metadata = dicominfo('originalfile.dcm'); 

% do something with the img 

% save altered DICOM with metadata 
dicomwrite(img, 'processedFile.dcm', metadata, 'CreateMode', 'copy');

然後，您可以撥打：

dcmodify [options] writtenDicomFile

其中writtenDicomFile是您用於保存文件的名稱，並在[選項]指定你怎麼改變文件。

來源

2013-02-21 14:14:16 fuyas

以何種格式應我保存數據？ – 2013-02-21 14:26:10

我把它作爲原始數據是因爲文檔中提到「-if --insert-from-file： dcmodify -if」PixelData = pixel.raw「file.dcm 插入文件'pixel.raw'的內容到'file.dcm'的PixelData元素，文件的內容將按原樣讀取。 OW數據預計是小尾數排序，如有必要將會被交換。不會進行檢查以確保數據量在其他屬性方面是合理的，如行或列。「 – 2013-02-21 14:29:55

」如果可能，請親切地說出我應該如何繼續處理此問題。 – 2013-02-21 14:35:40

修改dicom圖像並將其保存爲原始數據？

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