將原始數據保存爲tif

我需要分析tif文件中選定爲子矩陣的圖像的一部分。我想以原始格式顯示圖像，沒有裝飾（縮放，軸，標籤等）......我怎麼能這樣做？將原始數據保存爲tif

這是我現在使用的代碼：

submatrix = im[x_min:x_max, y_min:y_max] 
plt.imshow(submatrix) 
plt.savefig("subplot_%03i_%03i.tif" % (index, peak_number), format = "tif")

來源

2013-10-30 albus_c

我猜想'plt'是'matplotlib.pyplot'。 –

有可能是有用的[這裏]（http://stackoverflow.com/questions/8218608/scipy-savefig-without-frames-axes-only-content） –

可能重複的[Matplotlib情節：去除軸，傳說和空白]（http://stackoverflow.com/questions/9295026/matplotlib-plots-removing-axis-legends-and-white-spaces） –

首先，如果你只是想存儲原始值或原始值的灰度表現，這是最簡單的只使用PIL進行這個。

例如，這將產生一個10×10灰度TIF文件：

import numpy as np 
import Image 

data = np.random.randint(0, 255, (10,10)).astype(np.uint8) 
im = Image.fromarray(data) 
im.save('test.tif')

至於你爲什麼在matplotlib版本有更多的像素問題，那是因爲你implictly告訴它。 Matplotlib數字有一個尺寸（以英寸爲單位）和一個dpi（默認情況下，屏幕上顯示80，保存時顯示100）。此外，默認imshow將插值數組中的值，即使將插值設置爲最接近，保存的圖像仍然是您爲該圖指定的大小。

如果你想使用matplotlib保存在一個價值對一個像素的數字（例如，以方便使用色彩映射的），做一些與此類似：

import numpy as np 
import matplotlib.pyplot as plt 

dpi = 80 # Arbitrary. The number of pixels in the image will always be identical 
data = np.random.random((10, 10)) 

height, width = np.array(data.shape, dtype=float)/dpi 

fig = plt.figure(figsize=(width, height), dpi=dpi) 
ax = fig.add_axes([0, 0, 1, 1]) 
ax.axis('off') 

ax.imshow(data, interpolation='none') 
fig.savefig('test.tif', dpi=dpi)

來源

2013-10-31 00:46:38

我做了由Joe建議的更改，我得到以下錯誤：「ValueError：太多值解包」高度，寬度= np.array（data.shape，dtype = float）/ dpi。我應該改變什麼？ –

@albus_c - 這聽起來像你有一個3D數組？「data.shape」看起來像什麼？如果它是一個3D數組，你會想要做一些像'height，width，nbands = ...'。 –

@albus_c - 另外，如果你正在處理多波段圖像，直接使用'Image'（a.k.a.「PIL」）將它保存爲tif。我假設你想根據色彩圖（也可以用PIL來完成，也就是用PIL來完成單色圖像的着色，但構建色彩圖更困難）。 –

將原始數據保存爲tif

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