在R中調整熱圖的顏色和比例

我正在使用R和來自格子的函數levelplot()製作熱圖。在R中調整熱圖的顏色和比例

我使用的命令是：

data<-read.table("data_corr", header=T) 
library(gplots) 
library(lattice) 
z<-cor(data) 
levelplot(z)

，我得到一個數字這樣

one

三件事：

（一）行標籤弄髒，如何這可以解決得到更清晰的行標籤？（b）如何使用紅色，綠色和藍色而不是默認顏色（粉紅色，白色和藍色）？

（c）是否可以調整從0.90到1而不是0.84的比例？

在python中的解決方案也受到歡迎，在這種情況下，我有一個90 * 90（行*列）的關聯文件，說文件名是z.txt。如果區域爲TRUE使用

col.regions
顏色向量：

來源

2012-05-23 Angelo

在Python的matplotlib，該問題的答案是：

（一）與imshow選項情節interpolation="nearest"

（B）的colormaps可以在例如imshow選項cmap=cm.jet選擇。 More examples here。（c）爲了縮放，我假設你只想在閾值中顯示值並相應地顯示顏色條圖。使用imshow選項vmax和vmin。

這裏是一個最小的工作例如：

import numpy as np 
import pylab as plt 

# Create random matrix, save it to a text file 
N = 90 
A = np.random.random((N,N)) 
np.fill_diagonal(A,.95) 
np.savetxt("z.txt",A) 

# Load the data 
A = np.loadtxt("z.txt") 

# Apply a mask so values below .9 don't show 
A[A<.9] = None 

# Scale the values from .9 to 1.0 using vmin,vmax 
plt.imshow(A, interpolation='nearest', vmin=.9,vmax=1.0,cmap=plt.cm.jet) 
plt.colorbar() 
plt.show()

enter image description here

來源

2012-05-23 14:09:13 Hooked

太棒了。你能否給我建議一個鏈接或pdf，從那裏我可以瞭解更多關於Python構建圖形或圖形的信息。 – Angelo

@Angelo「matplotlib」入門的好地方就是圖庫：http://matplotlib.sourceforge.net/gallery.html查找示例，圖片是生成它的代碼的鏈接。 – Hooked

從幫助頁面levelplot。總的想法是，這應該是一箇中等大長度的顏色矢量（比區域的數量更長，默認爲100）。預計這個矢量會逐漸變化（因此附近的顏色會相似）。當實際選擇顏色時，它們被選擇爲沿着這個向量等距分佈。當在col.regions中有多於顏色的區域時，顏色被回收。實際顏色分配由level.colors執行，其單獨記錄。

來源

2012-05-23 11:17:55

除了卡爾的回答是：

可以通過例如設置默認col.regions

`trellis.par.set (regions = list (col = rainbow))

範圍的色標：見levelplot「s參數at。
行列名稱：見? xyplot，參數scales。

來源

2012-05-23 13:25:29 cbeleites

在R中調整熱圖的顏色和比例

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