在PBS作業腳本中獲取壁掛時間

Question

將作業腳本提交給PBS排隊系統時，自動或由用戶指定壁掛時間，例如，通過

#PBS -l walltime=1:00:00 

問題是如果這個時間可以從作業腳本訪問。有沒有一個環境變量或其他方式來獲得這個walltime。

最後，作業腳本應該不時決定是否有足夠的時間做更多的工作，以便作業不會被排隊系統消滅。

更新：

至少如果用戶指定的walltime在資源列表，我可以提出以下解決方法（工作對於bash）

read _ _ PBS_WALLTIME <<< `qstat -f $PBS_JOBID | grep "Resource_List.walltime"` 

從解析walltime qstat輸出並將值放入PBS_WALLTIME變量中。因此，命令

echo $PBS_WALLTIME 

將產生類似

1:00:00 

Answer 1

這是存儲在環境變量$ PBS_WALLTIME。

當然，這是TORQUE，我不確定你正在使用哪個PBS排隊系統。

Answer 2

我一直在尋找答案，上面的評論給了我一個想法，似乎工作得很好。您可以使用了qstat和使用sed抓住從它的相關信息：

qstat -f $PBS_JOBID | sed -rn 's/.*Resource_List.walltime = (.*)/\1/p' 

把這個在你的PBS腳本將打印出來的值，你可以使用標準的bash來的這個輸出存儲在一個變量：

WALLTIME=$(qstat -f $PBS_JOBID | sed -rn 's/.*Resource_List.walltime = (.*)/\1/p') 

您也可以使用它來獲取PBS_ *環境變量中不可用的其他信息，例如爲作業分配的內存量以及其他可能的東西。