嘗試和錯誤，除了突破？

我正在嘗試編寫代碼，以便消除結果文件中的重複項，即「N/A」行和下面的行。這裏是我有：嘗試和錯誤，除了突破？

with open('false_'+uniprotID+'.txt','w') as fileinput:   
     for index, (start, end) in enumerate(searchPFAM(fname)):  
      for item in lookup[uniprotID]: 
       for names in wholelookup[uniprotID]: 
        if re.search(r'\d+',names).group(0)==item and start <= int(item) <= end: 
         result = str(int(item) - start + 1) 
         try: 
          fileinput.write(">{0} | at position {1} | start= {2}, end= {3} | description: {4}\n".format(uniprotID, result, start, end, names)) 
          fileinput.write(''.join(makeList[start-1:end])) 
          textwrap.wrap(''.join(makeList[start-1:end]),width = 60) 
          fileinput.write('\n') 
         except ErrorIO as e: 
          break 
        else: 
         fileinput.write(">{0} | N/A | start= {1}, end= {2} | description: {3} \n".format(uniprotID, start, end, names)) 
         fileinput.write(''.join(makeList[start-1:end])) 
         textwrap.wrap(''.join(makeList[start-1:end]),width = 60) 
         fileinput.write('\n')

我的結果文件是這樣的：

Q14591 |在位置4 |開始= 174，結束= 196 |說明：A177T

YQCRHCSKSFSQRSDLVKHQRIH

Q14591 | N/A |開始= 174，結束= 196 |說明：M418T

YQCRHCSKSFSQRSDLVKHQRIH

Q14591 |在位置21 |開始= 398，結束= 420 |描述：M418T YACSDCTKSFSRRSDLVKHQRIH

Q14591 | N/A |開始= 398，結束= 420 |說明：M418T

YACSDCTKSFSRRSDLVKHQRIH

來源

2012-07-24 Chad D

您是否期待'try：'塊中的代碼引發任何特定的錯誤？如果沒有，'嘗試/除外'可能不是處理你重複的方式。 – Marius 2012-07-24 00:44:15

@Marius我應該怎樣處理這個問題？你有什麼建議嗎？在此先感謝:) – 2012-07-24 00:45:32

我一點都不確定是什麼讓你對這段代碼感到不滿...... – 2012-07-24 00:47:55

你爲什麼不過濾掉它們呢？

來源

2012-07-24 01:29:22

照顧你有重複的四行代碼，並從他們創造的功能。然後從兩個地方調用該函數。您必須對差異進行參數化，也就是說，爲兩個調用之間的差異提供不同的值可以給出一個參數。

例如：

def do_the_common_thing(fileinput, uniprotID, result, start, end, names): 
    fileinput.write(">{0} | {1} | start= {2}, end= {3} | description: {4}\n".format(uniprotID, result, start, end, names)) 
    fileinput.write(''.join(makeList[start-1:end])) 
    textwrap.wrap(''.join(makeList[start-1:end]),width = 60) 
    fileinput.write('\n')

這是一個很大的爭論，你也許可以想出一個更好的重構。

來源

2012-07-24 00:45:11

這樣做不會有任何區別，但..是嗎？我不確定 – 2012-07-24 00:53:59

對不起，我以爲你試圖刪除的「重複」是重複的代碼。這對你的問題沒有幫助，但無論如何這是個好主意...... :) – 2012-07-24 00:56:29

不，我的意思是結果文件中的重複 – 2012-07-24 00:56:52

嘗試和錯誤，除了突破？

回答

相關問題