將節點標籤添加到dendextend中的樹形圖

我有樹葉和節點標籤（class = phylo，使用read.tree讀入）的樹狀圖。將其轉換爲樹狀圖類後，節點標籤不再存在。但是，我想通過在某些節點上顯示標籤來繪製樹狀圖（即在所選簇的頂部以NODE_1等形式）。將節點標籤添加到dendextend中的樹形圖

有誰知道我如何獲得節點標籤樹狀圖類並將它們添加到情節？類似這樣的東西，但不是數字有id-s或標籤，只有一些節點選擇有標籤。

你可以使用'get_nodes_xy'，但我不知道如何管理如何存儲和告訴每個節點要繪製什麼的邏輯。 –

我想你的樹狀圖轉換爲phylo類as.phylo。繪圖時你可以做plot(phylo, show.node.label = TRUE)。

2017-10-20 08:44:30 patL

謝謝您的建議，但似乎繪製爲phylo不會顯示比例尺，水平繪圖不太容易，而且我不確定是否可以在此類中使用color_branches（）。 –

@Liis Kolberg你可以用'edge.color'爲你的phylo分支着色並設置你想要的顏色。使用函數add.scale.bar可以繪製您的比例。 – patL

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