我使用R中的滾動迴歸了很多,我的初始設置是一樣的東西:爲什麼RcppArmadillo的fastLmPure會在輸出中產生NA,但fastLm不會?
dolm <- function(x) coef(lm(x[,1] ~ x[,2] + 0, data = as.data.frame(x)))
rollingCoef = rollapply(someData, 100, dolm)
上面的例子完美的作品,但它是緩慢的,如果你有很多的迭代。
爲了加快速度,我決定試用Rcpp
包。
首先我用lm
代替fastLm
,結果有點快但是仍然很慢。所以這促使我嘗試在循環中編寫整個滾動迴歸的係數函數,並將它與Rcpp幫助一起整合到R中。
所以我已經改變了原來的RcppArmadillo的功能fastLm
這樣:
// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]
#include <RcppArmadillo.h>
using namespace Rcpp;
// [[Rcpp::export]]
List rollCoef(const arma::mat& X, const arma::colvec& y, double window) {
double cppWindow = window - 1;
double matRows = X.n_rows;
double matCols = X.n_cols - 1;
arma::mat coef(matRows - cppWindow, X.n_cols); // matrix for estimated coefficients
//for loop for rolling regression.
for(double i = 0 ; i < matRows - cppWindow ; i++ )
{
coef.row(i) = arma::trans(arma::solve(X(arma::span(i,i + cppWindow), arma::span(0,matCols)) , y.rows(i,i + cppWindow)));
}
return List::create(_["coefficients"] = coef);
}
,比它sourceCpp(file=".../rollCoef.cpp")
下載至R所以它比rollapply
快得多,它的小例子運行良好,但比我應用它大約20萬觀測數據它產生的NA的一半在輸出,同時rollapply
/fastLm
組合沒有產生任何。
所以在這裏我需要一些幫助。我的功能有什麼問題?爲什麼在我的函數輸出中有NA,並且在rollapply
/fastLm
中沒有NA,但是,如果我理解正確,它們都基於arma::solve
?任何幫助,高度讚賞。
UPDATE
下面是可重複的代碼:
require(Rcpp)
require(RcppArmadillo)
require(zoo)
require(repmis)
myData <- source_DropboxData(file = "example.csv",
key = "cbrmkkbssu5bn96", sep = ",", header = TRUE)
## in order to use my custom function "rollCoef" you should download it to R.
## The c++ code is presented above in the main question.
## Download it where you want as "rollCoef.cpp" and then download it to R with:
sourceCpp(file=".../rollCoeff.cpp"). # there should be your actual path.
myCoef = rollCoef(as.matrix(myData[,2]),myData[,1],260)
summary(unlist(myCoef)) # 80923 NA's
dolm = function(x) coef(fastLmPure(as.matrix(x[,2]), x[,1]))
myCoef2 = rollapply(myData, 260, dolm, by.column = FALSE)
summary(myCoef2) # 80923 NA's
dolm2 = function(x) coef(fastLm(x[,1] ~ x[,2] + 0, data = as.data.frame(x)))
myCoef3 = rollapply(myData, 260, dolm2, by.column = FALSE)
summary(myCoef3) # !!! No NA's !!!
head(unlist(myCoef)) ; head(unlist(myCoef2)) ; head(myCoef3)
所以我的函數的輸出是相同的與rollapply
結合RcppArmadillo的fastLmPure
的輸出和他們都產生NA的,但rollapply
與fastLm
沒有。據我所知,例如從HERE和HEREfastLm
基本上調用fastLmPure
,但爲什麼在第三種方法沒有NA? fastLm
有一些額外的功能可以防止我沒有發現的NA?
如何包含數據集的樣本? – nrussell
擁有MWE看看真的很不錯。即使使用簡單數據,我也無法讓您的前兩行工作 – ekstroem
我使用代碼示例更新了問題 –