與Rstudio合作編寫論文章節.Rnw

Question

我從我的大學獲得了2個使用LaTeX撰寫論文的文件。一個是.sty文件，另一個是.TeX文件。爲了在R工作室工作，我決定爲每章分別創建一個.Rnw文件，並將所有章節合併爲一個文件。我認爲.TeX文件是我可以合併所有章節的地方，因爲它提供了輸出中的示例章節。在R工作室的網站上有一個標題爲「處理多個Rnw文件」的頁面，它描述了這個過程（我猜），但對我來說並不清楚。它談到了我認爲是我的案例中的章節的「孩子」文件。所以我的一個簡單問題是，如果我爲每章創建了不同的.Rnw文件，我怎麼能要求R將它們合併到一個由大學提供給我的TeX文件中？請承擔我的無知，因爲我是可重複研究的新人。

Answer 1

假設你使用的是knitr（我強烈建議knitr超過sweave），簡單的方法是使用childchunk option。

舉個例子，假設你有2個章節，保存在文件chap1.Rnw和chap2.Rnw和主控文檔thesis.Rnw（與大學樣式文件名爲thesisStyle）。你可以把這些放在一起，裏面thesis.Rnw - 假設這些都是在同一個目錄 - 通過：

\documentclass{article} 
\usepackage{thesisStyle} 

\begin{document} 
% "include" chapter 1 
<<chap1, child='chapt1.Rnw'>>= 
@ 

% again with chapter 2 
<<chap2, child='chap2.Rnw'>>= 
@ 

\end{document} 

這時正好有RStudio編譯thesis.Rnw，它會吐出thesis.tex將擁有一切正常捆綁在一起。

雖然這不是全部！你可以開發chap1.Rnw，而不必給它自己的序言。也就是說，如果chap1.Rnw內容

<<echo=FALSE, cache=FALSE>>= 
set_parent('thesis.Rnw') 
@ 

\chapter{In a world where...} 
\section{Great voice actors in movie trailer history} 
ANYTHING YOU'D NORMALLY PUT IN AN .Rnw FILE 

，那麼你可以編譯chap1.Rnw像任何普通.Rnw文件，它會不會從thesis.Rnw序言之前運行的TeX任何後端你使用（通常pdflatex或xelatex ）。特別是，knitr會拍下chapt1.tex頂部的\documentclass{article}和\usepackage{thesisStyle}行。

謹慎的一句話，我發現在knitr中的孩子 - 父母模型是白色空間敏感的。所以，一定有塊

<<echo=FALSE, cache=FALSE>>= 
set_parent('thesis.Rnw') 
@ 

Answer 2

您有幾個選項。

一種選擇是隻用手處理每個章節。每個章節都有一個.Rnw文件，然後在Rstudio（或R）中運行knitr軟件包中的knit函數（可能有Rstudio按鈕或菜單直接執行此操作），將.Rnw文件轉換爲。 tex文件。然後在父LaTeX文檔中，您只需使用\include即可包含每章的.tex文件。這確實意味着你自己處理每一章，並且在你改變任何內容時不得不返回並重做它。

另一個選擇是創建一個父母和孩子的文件，knitr會自動理解和處理你（Rstudio正在使用knitr來處理.tex和最終的.pdf文件）。這page已經演示瞭如何創建父文件和子文件，只需修改提供給您的.tex文件以將重要內容包含在演示中（並可能將名稱更改爲.Rnw）即可。確保文檔類與提供給您的.sty文件相匹配，並保留.tex文件中的重要選項，但包含knitr演示中顯示的子文檔。這樣，您可以將文檔作爲一個整體進行處理，而不是對每個單獨的章節進行處理