ggtree

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是否可以將joyplot作爲面板添加到包含ggtree的圖中，如these examples所示？喜悅圖的例子是here。我意識到我可以手動將joyplot的物種標籤按照樹尖標籤的順序放置，但我正在尋找自動解決方案。我想自動將joyplot行與樹的提示相關聯，類似於boxplot數據如何與提示標籤相關聯。我認爲Guangchuang瑜在上面的鏈接示例提供合適的數據： require(ggtre

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丟棄提示後保存節點信息

當我在表中存儲樹和一些節點信息時，我想刪除提示，並相應地修改表。因此，需要在列節點中使用正確的新號碼的新表。 library(ape) library(ggtree) #make tree set.seed(2016-12-31) newrtree<-rtree(12) newrtreepo<-di2multi(newrtree, tol = 0.5) # make table wi

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將參數傳遞給geom_point2與地圖

我的目標是通過列表作爲函數geom_point2使用lapply或類似的mapply的參數。在類似的情況下，我必須成功通過列表（或列表）來geom_cladelabel爲： mapply(function (x,y,z,w,v,u,t,s) geom_cladelabel(node=x, label=y, align=F, etc. # Where x y z etc are lists.

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ggtree中的getSubtree函數，沒有這樣的函數

我已經安裝了ggtree包v1.8.2，並且我想使用getSubtree函數。不過，我得到一個錯誤suprising :)：錯誤getSubtree（）：找不到功能「getSubtree」即使我看到Rstudio幫助機能的研究作爲ggtree包的成員和正如它在軟件包描述中提到的：https://bioconductor.org/packages/release/bioc/manuals/ggt