p-value

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    我正在尋找一種方法來獲得一個描述適用於glm模型的p值的方法。下面是從lm手冊頁稍微修改例如: ctl <- c(4.17,5.58,5.18,6.11,4.50,4.61,5.17,4.53,5.33,5.14) trt <- c(4.81,4.17,4.41,3.59,5.87,3.83,6.03,4.89,4.32,4.69) conf<- c(rnorm(mean=-1, sd=1,

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    將星星放在條形圖或箱形圖上可以顯示一個或兩個組之間的顯着性水平(p值)是幾個例子: 星的數量是由p值定義爲例如一個可以把3星爲p值< 0.001,兩星爲p值< 0.01,和等等(雖然這從一篇文章變爲另一篇文章)。 和我的問題:如何生成類似的圖表?根據重要程度自動放置恆星的方法非常受歡迎。

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    據我所知,函數t.test提供了幾個統計值,以及一個p-value。但是,我不確定這是否是單面或雙面p-value。 有人能告訴我哪個p-value作爲輸出?

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    所以我繪製我的一些數據,這是在這種格式 Time SD Average Situation n se 而且我用這個代碼 ggplot(data, aes(x=Time, y=Average, colour=Situation)) + geom_errorbar(aes(ymin=Average-se, ymax=Average+se), width=.1) + geom_l

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    我對R相對較新,我試圖編寫一個置換來將我的p值轉換爲10塊。下面是我的數據頭。 > head(knockdown, n=10) chrs position pval gene_symbol Site_Class 2L 4998 0.73842731 CG11023 UPSTREAM 2L 4998 0.73842731 l(2)gl DOWNSTREAM 2L 5092 0.18