reproducible-research

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    我試圖讀取包含從GitHub一個dput要旨: library(RCurl) data <- getURL("https://gist.githubusercontent.com/aronlindberg/848b8efef154d0e7fdb4/raw/5bf4bb864cc4c1db0f66da1be85515b4fa19bf6b/pull_lists") pull_lists <- dg

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    我希望能夠使用knitr/rmarkdown生成一個文檔,它將所有輸出保持在一起,但是將代碼保留到最後,理想的是作爲引用腳註排序(即每個圖形或輸出的代碼可以在附錄中用腳註查找)。這可能嗎?

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    我目前正在撰寫一篇科學論文,並使用matplotlib生成大部分數字。我有一個使用makefile生成的管道,當我更新數據時,它會重新生成所有圖。我的問題是這些數字是由多個面板組成的,其中一些面板應該包含我使用Adobe Illustrator創建的矢量插圖。更新我的原始數據時,如何自動將圖形與插圖組合起來?我可以將矢量插圖保存爲光柵格式,然後使用matplotlib的imshow函數顯示它們,但

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    是否有將數值轉換爲字符的標準方式,並且應用了特定類型的格式。 我喜歡思考的東西: formatR(32390,"dollars") # returns "$32,390" formatR(1.25,"percent") # returns "125%" 顯然,沒有那麼難寫他們自己,而是需要這種事情是相當恆定的編寫報告時,並必須有一些打包出去了嗎?

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    我想使用make作爲可重複研究的工具。這項研究涉及到一個長的管道,我會爲許多獨立的數據集運行,要求我將「僞使」描述如下工作流程: datasets = foo bar baz $(datasets): path/to/result/%.dat: ./generate_dat_from % $(datasets): path/to/figs/%.png: path/to/resul

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    我希望運行隨機森林並行使用脫字符包,我希望設置種子重複性的結果在Fully reproducible parallel models using caret。但是,在下面的代碼中,我不明白第9行的代碼幫助:爲什麼我們要抽取22(加上第12,23行的最後一個模型)整數(對參數k的12個值進行評估)?有關信息,我希望運行5倍CV以評估RF參數'mtry'的584個值。任何幫助深表感謝。謝謝。 ## N

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    我有一個三維陣列中的R「改編」: > v1 <- c("100", "75", "31", "41", "1000", "69") > v2 <- c("10m", "6h", "5d", "11m", "6h", "5d") > arr <- array(c(v1, v2), dim=c(3, 2, 2), dimnames=list(c("d1", "d2", "d3"), c("m1",

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    我創建了一個閃亮的應用程序,用戶可以在其中加載文件並將該對象用作函數參數。我還打印代碼以在本地運行該功能(以便我或其他人可以複製和粘貼以重現結果)。 我想要做的就是能夠使用類似dput的東西,但將加載對象的文本表示保存到對象而不是控制檯。 dput輸出到控制檯,但只是返回它的第一個參數的副本。我可以使用deparse,但當對象的長度超過width.cutoff(缺省值60和最大值500)時會失敗。

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    如何獲得xtable(儘管我也有pander.table這個問題),希望將字母分配給打印函數中的數據框的列,而無需呈現表格然後手動輸入希臘字母的乳膠? 這裏的數據重複的例子: #data in chiSq <- 1600 df <- 850 p <- 0.95 CFI <- 0.95 TLI <- 0.95 RMSEA <- 0.04 LOWRMSEA <- 0.03 HIGHRM

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    如何獲取Julia會話導入/使用的軟件包列表? Pkg.status()列出所有已安裝的軟件包。我感興趣的是那些已導入/通過using ...或import ... 似乎whos()包含相關信息的加載(名稱以及它是否是一個模塊或沒有)。 whos()的輸出可以在變量中捕獲嗎?