rscript

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我通常在集羣計算機上工作。我有一些非常大的Rscript用於運行數據。完整的Rscript需要大約5個小時才能運行。爲此，我通過使用qsub提交作業來使用羣集。這使我可以離開我的電腦並等待集羣運行。但是，我想運行這個特殊的Rscript 20個不同的次數進行微小的更改。我一直在做的是等待集羣作業完成。然後進入Rscript並修改文件名，然後將另一個作業發送到羣集。我的問題是這樣的：在我將作業提

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在Bash命令行中的文件上運行R函數

我正在嘗試將R（strandcode.txt）中寫入的函數遍歷給定目錄中的所有文件。 strandcode.txt如下所示，它是計算卡方檢驗的簡單函數。 strand <- function(file){ data <- as.data.frame(read.table(file)) colnames(data) <- c('chr', 'pos', 'fwd', 'bkwd') data$

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的R - 有數據的限制，可以通過RSCRIPT

我通過這個命令調用RSCRIPT被傳遞到R檔： RSCRIPT myScript.R VAR1，VAR2，VAR3 這個工作，如果變量的長度很小。但是，一旦超過一定的長度（比如超過1000個字符）就會中斷。是否有限制我可以傳遞的字符串變量的長度和/或是否有作爲參數傳遞給RScript的總數（var1 + var2 + var3）數據大小的限制。謝謝！

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在x軸上有ID的R腳本圖和y軸上的所有列值

我是R腳本的新手，需要繪製數據的幫助。我的數據是這樣的 run1Seek run2Seek run3Seek 1 12 23 28 2 10 27 0 3 23 19 0 4 22 24 0 5 21 26 0 6 11 26 0 我需要繪製在x軸和run1Seek，run2Seek，run3Seek值在y軸的ID值。下面的圖片中是這樣的： I

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PDF繪圖在R與Rscript中的表現有所不同

我有一個代碼，用於生成循環的每次迭代並在pdf的單獨頁面上導出繪圖。當我在Windows 7的RGui或Rstudio中運行它時，此代碼可以正常工作。但是，當我嘗試通過命令提示符使用Windows任務管理器或Rscript自動執行它時，我得到一個通用的，默認大小的Rplot.pdf輸出，而不是使用我在函數pdf（）中分配的維度格式化mtcars.pdf。在這裏，我使用mtcars來複制我的問題

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如何在使用Rscript時在屏幕上保留RGL圖？

我有一個非常簡單的.R文件： library("rgl") par(ask=TRUE) x=c(0.44,0.45) y=c(0.2, 0.3) z=matrix(c(1,2,3,4),nrow=length(x)) persp3d(x,y,z) 當我打開CMD屏幕和導航到我的R安裝過程中，並嘗試 Rscript P:\pathtoscript\example.r 我看到pe

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如何匹配以下模式的正則表達式？

我想寫一個腳本，應該像下面這樣工作，但不知何故我無法獲得寫入方式來放置語法。我有像S_12_O_319_K4me1這樣的文件夾。雖然在每個文件夾中的內容是S_12_O_319_K4me1_S12816.sorted.bam。所以我想編寫一個腳本，我的腳本在一個循環中進入我的同名文件夾，然後標識*.bam文件並執行操作，但我無法放置正則表達式。這是我試過的： #!/bin/bash #$ -

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如何在.sh文件中運行R作業

我正在嘗試運行R腳本。這些都是從我的[R腳本big2.r dataa <- read.csv("/home/people/R2/big2.csv") write.csv(head(dataa), file="/home/people/R2/head.csv") 一些行，當我在終端執行R CMD BATCH big2.r，它給了我一個.Rout與head.csv文件一起。但是當我嘗試，使用

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字符串加上括號中的數據幀

我有了這個數據幀稱爲DF： ColumnA ColumnB String1 A String2 A String3 B String4 A ... ... 每串ColumnA有不同的lenght。如果ColumnB == A在同一行中的值，我想將ColumnA的值放在括號內。如果ColumnB == B中的值我想要添加方括號。所以它看起來像： ColumnA ColumnB (

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如何從RStudio開發的R Project製作可執行文件？

我非常想問如何從R Project中創建一個可執行文件，其中包含RStudio中的一些R腳本？不要緊，我們必須先安裝R。不管它是.exe還是.bat等。我已經在R中用tcltk和tcltk2做了GUI，所以我只需要分發它。任何人都有解決方案？請。它必須在2周內完成。